Rotor-Gene链融解曲线法甲基化标记筛选技术的建立
本文选题:DNA甲基化 切入点:链融解曲线法 出处:《郑州大学学报(医学版)》2008年01期 论文类型:期刊论文
【摘要】:目的:建立基于Rotor-Gene的链融解曲线法的甲基化标记筛选技术,分析各种影响因素,评估其实用性。方法:克隆Hela细胞雄激素受体基因外显子-1的Bisulfite-PCR产物,挑出经测序证实的可以代表不同甲基化程度的一组质粒,并以之为模板,在Rotor-Gene3000实时定量PCR仪进行扩增和链融解,分析融链温度、链融解曲线与甲基化程度、甲基化模式的相关性及各种影响因素。结果:基于Rotor-Gene的链融解曲线法,不仅可以区分甲基化与非甲基化,而且能够鉴别片段内细微的甲基化差异;主要的影响因素有升温幅度、缓冲液离子强度、产物浓度等。结论:基于Rotor-Gene的链融解曲线法,可以集扩增和链融解于一体,是一种经济简便的甲基化分析技术,可用于样品的甲基化筛选。
[Abstract]:Aim: to establish a methylation marker screening technique based on Rotor-Gene chain fusion curve, analyze various influencing factors and evaluate its practicability. Methods: Bisulfite-PCR products of androgen receptor gene exon 1 were cloned from Hela cells. A group of plasmids identified by sequencing as representing different levels of methylation were selected and used as templates for amplification and chain fusion using Rotor-Gene3000 real-time quantitative PCR apparatus to analyze the melting chain temperature, chain melting curve and methylation degree. Results: the chain fusion curve method based on Rotor-Gene could not only distinguish methylation from demethylation, but also distinguish the slight difference of methylation within segments. Conclusion: the chain melting curve method based on Rotor-Gene can integrate amplification and chain fusion. It is an economical and simple methylation analysis technique and can be used for methylation screening of samples.
【作者单位】: 华中科技大学同济医学院法医学系 河南科技大学法医学院 河南科技大学法医学院 华中科技大学同济医学院法医学系 华中科技大学同济医学院法医学系
【分类号】:D919
【参考文献】
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【共引文献】
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,本文编号:1611802
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