不同水陆生境中喜旱莲子草表观遗传调控因子动态表达式样分析

发布时间：2016-11-22 13:31

  本文关键词：中国林业生物安全风险评价与管理对策研究，由笔耕文化传播整理发布。

《复旦大学》 2014年

不同水陆生境中喜旱莲子草表观遗传调控因子动态表达式样分析

邓莹  

【摘要】：喜旱莲子草(Alternanthera philoxeroides (Mart.) Griseb.)是一种入侵植物,种内遗传多样性很低,主要依靠极强的表型可塑性入侵不同生境。表型可塑性变异与基因选择性表达密切相关,而表观遗传调控因子(如：DNA甲基化)参与基因的表达调控,介导可塑性变异的发生。为了解喜旱莲子草适应不同水陆生境过程中表观遗传调控因子的作用,我们对同质园中栽培的喜早莲子草进行不同水陆条件处理,并运用实时荧光定量PCR、亚硫酸氢钠测序、RNA-Seq高通量测序等方法检测各类表观遗传调控因子在不同环境条件下动态表达的特点,为研究喜旱莲子草表型可塑性变异发生的分子基础提供依据。研究结果显示：(1)16个表观遗传调控相关基因在不同水陆处理条件下、在不同处理时间点表达水平变化显著,且多在水淹处理早期被强烈诱导上调。(2)两个在不同水陆处理下显著差异表达基因的启动子区中多个胞嘧啶位点甲基化修饰式样随不同处理条件以及不同处理时间呈现动态变化的特点,其中涉及一些保守调控元件和部分连续分布的非对称胞嘧啶位点。(3)对不同水陆处理条件下miRNA表达谱进行分析,发现118个与不同处理条件相关且在不同处理时间点差异表达的miRNA,根据表达式样将这些miRNA分为12类。本研究结果初步揭示了喜旱莲子草响应不同水陆生境过程中表观遗传调控因子的动态表达式样,证实了表观遗传变异与喜旱莲子草表型可塑性变异的相关性,为深入研究喜早莲子草通过表型可塑性变异广泛适应不同水陆生境的表观遗传调控机制提供了基本信息。

【关键词】：
【学位授予单位】：复旦大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：Q943.2
【目录】：

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本文编号：185827