贵阳地区2013年手足口病非EV71、非CVA16型肠道病毒的检测分析

发布时间：2018-01-20 18:27

  本文关键词： 手足口病 肠道病毒 基因型　出处：《重庆医学》2016年17期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的了解贵阳地区引起手足口病(HFMD)的非肠道病毒71型(EV71)、非柯萨奇病毒A(CVA)16型肠道病毒的病原构成及优势型别,为贵阳地区HFMD防治工作提供依据。方法收集2013年4~6月检测为非EV71、非CVA16型肠道病毒的HFMD患者肛拭子标本共107例。提取病毒核酸,用巢式RT-PCR法扩增病毒VP4区序列,对PCR阳性扩增产物进行测序,通过与GenBank收录的序列BLAST比对确定病毒型别;并对优势型别进行序列和进化分析。结果 107例标本中共有100例标本巢式RT-PCR检测为阳性(93%),其中100例PCR产物测序成功,经BLAST比对后,100例标本病毒型别均得到确定:CVA6为46例,CVA10为30例,CVA5为10例,CVA2为6例,CVA3和CVA4各2例,CVB2和ECHO16各2例。CVA6在型别确定的非EV71、非CVA16型肠道病毒中占42.99%,为优势肠道病毒型别。结论贵阳地区引起HFMD的肠道病毒型别多样,CVA6为非EV71、非CVA16型肠道病毒中的优势型别。
[Abstract]:Objective to investigate the pathogenic composition and dominant types of non-enterovirus 71 (EV71A) and non-coxsackie virus (NCoV) ACCA16 enterovirus causing HFMD in Guiyang area. To provide the basis for the prevention and treatment of HFMD in Guiyang area. A total of 107 anal swabs from patients with non CVA16 enterovirus (HFMD) were collected. The nucleic acid was extracted and the nucleotide sequence of the VP4 region was amplified by nested RT-PCR. The PCR positive amplification products were sequenced, and the virus type was determined by comparing with the sequence BLAST included in GenBank. The sequence and evolution of the dominant type were analyzed. Results 100 cases of nested RT-PCR were detected positive by nested RT-PCR, among which 100 cases of PCR products were sequenced successfully. After BLAST comparison, the virus types of 100 specimens were confirmed to be 46 cases, 30 cases of CVA10, 10 cases of CVA5, 6 cases of CVA2, 6 cases of CVA2, 6 cases of CVA5, 30 cases of CVA10, 10 cases of CVA5 and 6 cases of CVA2. There were 2 cases of CVB2 and 2 cases of ECHO16 in CVA3 and 2 cases in CVA4, respectively. CVA6 accounted for 42.99% of non-EV71, non-#en3# enterovirus. Conclusion the enterovirus type caused by HFMD in Guiyang area is non-EV71, and it is the dominant type of non-EV71enterovirus.
【作者单位】： 贵州省贵阳市第五人民医院检验科;贵阳医学院检验系;
【基金】：贵阳市科技局项目(筑科合[2013103]9号) 贵阳市高层次创新型青年卫生人才项目(筑卫合[2013]创2号)
【分类号】：R512.5;R440
【正文快照】： 手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)主要由肠道病毒(enteroviruses,EV)引起的出疹发热急性传染病,引起HFMD的病毒属于小RNA病毒科EV属,引发HFMD的有20多个血清型,包括柯萨奇病毒A组(CVAsckievirus A,CVA)的2、4、5、7、9、10、16型等,B组(CVAsckievirus B,CVB)的1、2

【参考文献】

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本文编号：1449158