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皮氏罗尔斯顿菌鉴定药物敏感性及多位点序列分型分析

发布时间:2018-01-22 11:29

  本文关键词: 罗尔斯顿菌属 细菌鉴定 药物敏感实验 多位点基因序列研究 出处:《中国人民解放军医学院》2015年硕士论文 论文类型:学位论文


【摘要】:1、目的:(1)建立基于PCR的细菌鉴定方法,为准确鉴定罗尔斯顿菌提供新的方法。(2)测定菌株的药物敏感性,了解其耐药表型,为临床合理应用抗生素提供依据。(3)选择利用6个基因位点进行分析,初步建立罗尔斯顿菌属细菌的MLST体系,为其分型分析提供参考。(4)国内首次报道一例罗尔斯顿菌属中危险罗尔斯顿菌所致感染的病例。2、方法:(1)收集2008年1月至2013年12月我院经VITEK 2细菌鉴定系统鉴定为皮氏罗尔斯顿菌的非重复菌株48株,以细菌特异PCR实验进行重新鉴定,并以16S rDNA鉴定结果为标准,比较三者差异。(2)分别以K-B法及MIC法测定菌株的药物敏感性,并通过Carba NP法检测菌株中碳氢霉烯酶。(3)通过测定菌株6个基因位点各片段的核苷酸序列,对菌株进行多位点序列分型分析。(4)回顾性分析1例危险罗尔斯顿菌所致感染患者的临床资料及病原学资料。3、结果:(1)经VITEK 2细菌鉴定系统鉴定,48株细菌均为皮氏罗尔斯顿菌;经细菌特异PCR实验鉴定,上述48株细菌中,1株危险罗尔斯顿菌,8株解甘露醇罗尔斯顿菌,30株皮氏罗尔斯顿茵;经16S rDNA鉴定,上述48株细菌中,1株危险罗尔斯顿菌,7株解甘露醇罗尔斯顿菌,34株皮氏罗尔斯顿菌,1株木糖氧化无色杆菌,2株洋葱伯克霍尔德菌,3株嗜麦芽寡养单胞菌。(2)皮氏罗尔斯顿菌对β-内酰胺类/β-内酰胺酶、左氧氟沙星、米诺环素、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲嗯唑等抗生素敏感性较高,对氨曲南、美罗培南、氨基糖甙类、多粘菌素B、呋喃妥因等抗生素的耐药率较高。解甘露醇罗尔斯顿菌一般对氨曲南、氨基糖甙类、多粘菌素B等高度耐药,对环丙沙星、左氧氟沙星、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲嗯唑等一般均敏感,Carpa NP实验检测菌株中碳氢酶烯酶结果为阴性。(3)MLST分析显示我院42株罗尔斯顿菌共包含18个ST序列型,其中ST9序列型最多,共22株,为优势型别,其次为ST2型和ST4型各2株,其余ST型均仅1株。UPGMA法进行聚类分析显示42株罗尔斯顿菌属细菌共分为2个群(A和B)和18个基因型,A群含8个基因型,共10株菌,其中4株经16SrDNA鉴定为皮氏罗尔斯顿菌,6株为解甘露醇罗尔斯顿菌,B群含10个基因型,共32株菌,其中1株为解甘露醇罗尔斯顿菌,1株为危险罗尔斯顿菌,余均为皮氏罗尔斯顿菌。(4)一名93岁女性患者痰标本中发现危险罗尔斯顿菌,初始被错误鉴定为皮氏罗尔斯顿菌,药敏提示菌株对β-内酰胺类/β-内酰胺酶、部分头孢类类、喹诺酮类以及磺胺类敏感性较好,对氨曲南、呋喃要因、多粘菌素B以及氨基糖甙类抗生素耐药,经头孢他啶、环丙沙星抗感染治疗后好转。4、结论:(1)利用细菌特异PCR实验来鉴定罗尔斯顿菌属中的临床致病菌简便、快捷、准确度和特异度较高。(2)皮氏罗尔斯顿菌菌株对β-内酰胺类/β-内酰胺酶抑制剂、左氧氟沙星、米诺环素、甲氧苄氨嘧射磺胺甲嗯唑等抗生素敏感性较高。解甘露醇罗尔斯顿菌菌株对对环丙沙星、左氧氟沙星、甲氧苄氨嘧对磺胺甲嗯唑等一般均敏感;罗尔斯顿菌株中可能存在碳氢酶烯酶外的其他机制介导耐碳青霉烯类抗生素菌株的耐药性。(3)利用atpD、gltB、gyrB、lepA、phaC、recA6个基因位点可初步对罗尔斯顿菌属细菌进行多位点序列分型研究。(4)临床危险罗尔斯顿菌所引起的感染较少见,临床症状无特异性,确诊依赖于微生物学的准确鉴定,治疗可结合药敏实验结果来选择敏感抗生素。
[Abstract]:1 . Objective : ( 1 ) To establish a PCR - based method of bacterial identification to provide a new method for the accurate identification of Ralstonia . ( 4 ) A retrospective analysis of the clinical data and pathogenic information of 1 case of patients with infection caused by dangerous Ralstonia . The results were as follows : ( 1 ) The results were as follows : ( 1 ) The 48 strains were identified by VITEK 2 bacteria identification system . ( 3 ) The results showed that 42 strains of Ralstonia were divided into 2 groups ( A and B ) and 18 genotypes . ( 3 ) Using atpD , gltB , gyrB , lepA , phaC and recA6 gene loci , we can carry out a multi - site sequence typing on the bacteria of the genus Ralstonia .

【学位授予单位】:中国人民解放军医学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R446.5

【共引文献】

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2 Tsz Wai Ng;Guocheng Huang;Po Keung Wong;;Investigation of drinking water bacterial community through high-throughput sequencing[J];Journal of Environmental Sciences;2015年11期



本文编号:1454541

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