应用定量蛋白组学技术筛选不同生存期食管癌患者血清差异蛋白

发布时间：2017-03-25 16:15

  本文关键词：应用定量蛋白组学技术筛选不同生存期食管癌患者血清差异蛋白，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景 食管癌具有极强的“中国特色”,仍是我国与肿瘤相关死亡的主要原因,呈明显地域性分布。预后极差,5年生存率只有15%左右。目前,食管癌临床预后评价仍以TNM分期为标准。然而,大规模流行病学调查时发现一些肿瘤组织分期与预后不一致的病例,即属于同一TNM分期患者具有不同的预后。这些提示,单纯使用形态学改变作为判断预后的指标存在一定的局限性。因此,寻找与食管癌预后相关预后评价分子指标具有重要的理论意义。 目的 筛选与食管癌生存期相关的差异表达蛋白,为指导临床治疗和判断预后风险提供参考。 方法 1.收集食管癌患者的术前血清标本及临床病理资料,并跟踪随访,明确患者术后生存时间,随访时间截止到2013年10月。根据生存期进行分组：生存期3年组；3年≤生存期≤5年组；生存期5年组。每组随机筛选10例血清样品,同时收集正常对照组血清10例。 2.去除血清中的高丰度蛋白质,进行8标同位素相对和绝对定量标记(iTRAQ),之后联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行分析得到多肽片段定量信息。 3.多肽质谱分析结果经Mascot2.2软件查库及Proteome Discovererl.3软件分析,得到蛋白的定性信息以及其在各组的相对定量。 4.四组样品进行单因素方差分析,采用生物信息学对显著差异表达蛋白进行分类注释。通过EMBI-EBI蛋白质数据库获取详细蛋白质信息,筛选出与生存期相关的候选蛋白。 结果 1.在食管癌不同生存期患者血清中经质谱分析查库搜索共鉴定出556种蛋白,具有明显表达差异的蛋白253种(P0.05) 2.鉴定的556种蛋白分别参与18种生物学过程：蛋白代谢、刺激反应、分子转运、细胞转化等；参与17种细胞组成,如：细胞外基质、细胞膜、细胞质、细胞器、细胞核等；共有14种分子功能,包括蛋白结合、金属离子结合、酶活性调节、核苷酸结合等。 3.以正常对照组为参照,在食管癌患者血清中有52种蛋白与食管癌生存期呈正相关,如载脂蛋白D、a-2巨球蛋白随生存期延长其表达明显上调；与生存期呈负相关的蛋白有48种,如血管紧张肽原、碳酸酐酶Ⅱ随生存期延长其表达明显下降。 结论 本研究提示应用iTRAQ技术寻找食管癌血清肿瘤标记物具有较好的应用前景,血管紧张肽原、碳酸酐酶Ⅱ、载脂蛋白D、a-2巨球蛋白有可能作为食管癌判断预后风险的生物标记。
【关键词】：食管癌 定量蛋白组学 iTRAQ LC-MS/MS
【学位授予单位】：新乡医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R473.73
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 前言9-10
• 材料与方法10-17
• 结果17-22
• 讨论22-30
• 小结30
• 今后研究方向30-31
• 参考文献31-37
• 综述：iTRAQ技术在消化系统肿瘤中的应用37-48
• 参考文献44-48
• 附录48-56
• 攻读学位期间发表文章情况56-57
• 致谢57-58
• 个人简历58

【参考文献】

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本文编号：267457