海河口沉积物nirS型反硝化微生物多样性研究
发布时间:2023-04-02 20:07
以海河口典型淡水、淡海水以及海水环境的沉积物样品为研究对象,采用克隆文库及典范对应分析等方法研究了nirS型反硝化微生物群落结构的多样性。3个站位共获得154条有效序列,97%序列相似性水平划分为66个OTUs,海水环境的沉积物站位nirS型反硝化微生物多样性最高。系统进化分析显示,全部OTUs序列被划分为7个簇,最相近序列的微生物主要来源于河口、富营养化海湾、人工湿地及海水养殖沉积物等环境。海河口具有独特的反硝化微生物群落分布格局,典范对应分析结果表明该区域的盐度、有机碳以及氮相关营养盐水平是影响其群落特征的重要因素。
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 环境因子的测定
1.3 克隆文库构建及分析
1.3.1 宏基因组DNA提取
1.3.2 克隆文库构建
1.3.3 nirS基因克隆文库分析
1.3.4 构建nirS基因系统发育树
1.3.5 典范对应分析(canonical correspondence analysis, CCA)
1.3.6 nirS基因核酸序列登记号
2 结果与讨论
2.1 样品环境因子
2.2 nirS基因克隆文库的多样性
2.3 系统发育分析
2.4 典范对应分析
3 结 论
本文编号:3779864
【文章页数】:5 页
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1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 环境因子的测定
1.3 克隆文库构建及分析
1.3.1 宏基因组DNA提取
1.3.2 克隆文库构建
1.3.3 nirS基因克隆文库分析
1.3.4 构建nirS基因系统发育树
1.3.5 典范对应分析(canonical correspondence analysis, CCA)
1.3.6 nirS基因核酸序列登记号
2 结果与讨论
2.1 样品环境因子
2.2 nirS基因克隆文库的多样性
2.3 系统发育分析
2.4 典范对应分析
3 结 论
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