分子对接和光谱法研究FTO蛋白与小分子结构类似物的相互作用机制
发布时间：2021-03-10 18:00
FTO（fat mass and obesity-associated）是第一个肥胖相关基因。自FTO基因表达的蛋白被确认为首个mRNA的m6A去甲基化酶以来,其生物学功能得到广泛拓展。近年来,研究发现FTO不仅引起肥胖及肥胖相关疾病,也影响肝炎、多种癌症以及急性脊髓白血病的发展。因此,将FTO作为特定疾病的药物靶点,开发靶向FTO选择性抑制剂,已成为研究的热点。研究FTO蛋白与小分子的相互作用机制,能够指导基于结构的靶向FTO药物设计。本论文运用荧光分析法、圆二色谱法等多种光谱学方法,以及分子对接技术,研究了五种不同结构的小分子与FTO蛋白的相互作用,主要包括以下部分:第一章简要综述了FTO蛋白的结构与生物学功能、本论文的研究方法、内容及意义。第二章研究了四种黄酮类化合物（白杨素、黄芩素、大豆苷元和高良姜素）与FTO的作用机理。结果显示,四种化合物对FTO的荧光猝灭以静态猝灭为主。结合强度的顺序为白杨素>黄芩素>大豆苷元>高良姜素。第三章对八种2H-氮杂丙烯啶衍生物（1b～1h）与FTO的相互作用进行研究。八种2H-氮杂丙烯啶衍生物均引起FTO...
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：123 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
FTO蛋白的结构图
第二章四种黄酮类化合物与FTO蛋白的相互作用研究23大于峰1，且有明显的红移，说明FTO多肽骨架发生松动。四种黄酮类化合物均与FTO的相互作用，并导致FTO的构象发生一定的变化。图2.7FTO和黄酮类化合物-FTO体系的三维荧光图，pH=7.4，T=301K。Cflavonoids=4.0×10-7M。2.3.6.3近紫外圆二色谱圆二色谱最能灵敏、方便地检测溶液中蛋白质结构的变化。图2.8给出四种黄酮类化合物与FTO作用前后的CD光谱。FTO蛋白在208nm和220nm附近
第二章四种黄酮类化合物与FTO蛋白的相互作用研究26FTO+高良姜素AB图2.9FTO与黄酮类化合物对接的最优模型。图A中，FTO是用固体丝带显示；图B中，结合位置的氨基酸残基以线状表示，绿色棍状分子代表黄酮类化合物。绿色虚线标记氢键。表2.5四种黄酮类化合物在结合处的氨基酸残基Compound氨基酸残基白杨素PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ARG96，ILE97，LEU113，PHE384，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468黄芩素CYS77，PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ILE97，LEU113，PHE114，VAL116，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468大豆苷元PHE79，ARG80，ASP81，ILE97，LEU98，PHE114，THR115，VAL116，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468高良姜素PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ARG96，ILE97，LEU113，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN4682.4本章小结本章用多种光谱学方法和计算机对接技术，探究了白杨素、黄芩素、大豆苷元和高良姜素与FTO的相互作用，结论如下：（1）四种黄酮类化合物均可与FTO结合，同时发生非辐射能量转移。荧光实验和紫外光谱证明黄酮类化合物与FTO之间存在静态猝灭。（2）白杨素和FTO作用能力最强，其次依次为黄芩素、大豆苷元、高良姜素。羟基的位置对黄酮类化合物与FTO相互作用的影响较大，间位羟基对结合有利。（3）构象研究表明，添加黄酮类化合物后的FTO多肽骨架发生变化，四种
【参考文献】：
期刊论文
[1]1,3,4-噁二唑衍生物抗癌活性研究新进展[J]. 胡玲,韩学岗,李海静,李学军,张福田. 精细化工中间体. 2019(05)
[2]异烟肼衍生物及其抗结核活性[J]. 张姝,徐志,徐磊,冯连顺. 国外医药(抗生素分册). 2017(05)
[3]大豆素的营养生理功能研究进展[J]. 赵向辉,龚剑明,杨竹青,刘婵娟,瞿明仁. 中国饲料. 2015(04)
[4]丹酚酸B与牛血清白蛋白相互作用的电化学研究[J]. 王月荣,刘馥婷,章弘扬,张敏,胡坪. 分析测试学报. 2012(03)
[5]分子间非共价相互作用的质谱分析方法研究进展[J]. 张瑞萍,再帕尔·阿不力孜. 分析测试学报. 2005(01)
博士论文
[1]若干功能小分子与蛋白质的分子识别及作用机理研究[D]. 翟春熙.吉林大学 2006
硕士论文
[1]FTO mRNA在前列腺癌和肾癌中的表达[D]. 马宏召.苏州大学 2018
[2]量热法与光谱法研究FTO蛋白与小分子类似物的相互作用[D]. 任婷.郑州大学 2017
本文编号：3075047
【文章来源】：郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】：123 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
FTO蛋白的结构图
第二章四种黄酮类化合物与FTO蛋白的相互作用研究23大于峰1，且有明显的红移，说明FTO多肽骨架发生松动。四种黄酮类化合物均与FTO的相互作用，并导致FTO的构象发生一定的变化。图2.7FTO和黄酮类化合物-FTO体系的三维荧光图，pH=7.4，T=301K。Cflavonoids=4.0×10-7M。2.3.6.3近紫外圆二色谱圆二色谱最能灵敏、方便地检测溶液中蛋白质结构的变化。图2.8给出四种黄酮类化合物与FTO作用前后的CD光谱。FTO蛋白在208nm和220nm附近
第二章四种黄酮类化合物与FTO蛋白的相互作用研究26FTO+高良姜素AB图2.9FTO与黄酮类化合物对接的最优模型。图A中，FTO是用固体丝带显示；图B中，结合位置的氨基酸残基以线状表示，绿色棍状分子代表黄酮类化合物。绿色虚线标记氢键。表2.5四种黄酮类化合物在结合处的氨基酸残基Compound氨基酸残基白杨素PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ARG96，ILE97，LEU113，PHE384，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468黄芩素CYS77，PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ILE97，LEU113，PHE114，VAL116，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468大豆苷元PHE79，ARG80，ASP81，ILE97，LEU98，PHE114，THR115，VAL116，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN468高良姜素PHE79，ARG80，ASP81，LEU82，ARG96，ILE97，LEU113，GLN385，GLY386，ASN387，TYR389，CYS392，GLN4682.4本章小结本章用多种光谱学方法和计算机对接技术，探究了白杨素、黄芩素、大豆苷元和高良姜素与FTO的相互作用，结论如下：（1）四种黄酮类化合物均可与FTO结合，同时发生非辐射能量转移。荧光实验和紫外光谱证明黄酮类化合物与FTO之间存在静态猝灭。（2）白杨素和FTO作用能力最强，其次依次为黄芩素、大豆苷元、高良姜素。羟基的位置对黄酮类化合物与FTO相互作用的影响较大，间位羟基对结合有利。（3）构象研究表明，添加黄酮类化合物后的FTO多肽骨架发生变化，四种
【参考文献】：
期刊论文
[1]1,3,4-噁二唑衍生物抗癌活性研究新进展[J]. 胡玲,韩学岗,李海静,李学军,张福田. 精细化工中间体. 2019(05)
[2]异烟肼衍生物及其抗结核活性[J]. 张姝,徐志,徐磊,冯连顺. 国外医药(抗生素分册). 2017(05)
[3]大豆素的营养生理功能研究进展[J]. 赵向辉,龚剑明,杨竹青,刘婵娟,瞿明仁. 中国饲料. 2015(04)
[4]丹酚酸B与牛血清白蛋白相互作用的电化学研究[J]. 王月荣,刘馥婷,章弘扬,张敏,胡坪. 分析测试学报. 2012(03)
[5]分子间非共价相互作用的质谱分析方法研究进展[J]. 张瑞萍,再帕尔·阿不力孜. 分析测试学报. 2005(01)
博士论文
[1]若干功能小分子与蛋白质的分子识别及作用机理研究[D]. 翟春熙.吉林大学 2006
硕士论文
[1]FTO mRNA在前列腺癌和肾癌中的表达[D]. 马宏召.苏州大学 2018
[2]量热法与光谱法研究FTO蛋白与小分子类似物的相互作用[D]. 任婷.郑州大学 2017
本文编号：3075047
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