氨基酸分子的分子形貌理论研究
发布时间：2021-06-11 03:48
分子形貌理论（MFT）既能展示分子的形状、大小与电子密度,还能指明分子间相互作用的位点。但该理论在计算过程中需要计算大量复杂的分子积分项,因此不适用于大分子体系的研究。本文在分子形貌理论的基础上,发展了快速预测单电子作用势势垒——Dpb与半经验描绘分子形貌的方法,通过对非解离状态、两性离子状态下20种氨基酸分子的研究,验证了新方法不仅可以大幅缩短计算时间而且具有非常高的精确性。具体的研究内容如下:（1）以水分子为例,我们推导出了快速预测Dpb的半经验表达式。作为应用,在MP2/6-311++G（d,p）理论水平下,分别对非解离状态与两性离子状态下的氨基酸分子体系,用精密从头算与半经验方法进行了Dpb的计算。结果表明,新方法与从头计算得到的Dpb平均相对误差仅为0.236‰。根据Dpb值越大,化学键越强的规律可知,在氨基酸分子中,总是优先解离α-COOH,其次是α-NH2,然后是N-H,最后是C=O,也就是说,羧基的活泼性强于氨基,该结论与其他学者的研究结果...
【文章来源】：辽宁师范大学辽宁省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
H2O分子及O、H原子中单电子作用势随电子坐标的变化关系图
图 2.1 H2O 分子及 O、H 原子中单电子作用势随电子坐标的变化关系图 variation diagram of the potential acting on single electron in a molecule wielectronic coordinates in H2O molecule and atoms O and H
- 13 -图 2.3 采用 MP2/6 311 G(d,p)优化的 NDS 下 20 种氨基酸分子结构示意图g. 2.3 A schematic diagram of 20 amino acid molecules at NDS optimized by MP2/6 311 G(3.2 计算细节我们知道，化学键的强弱可以用pbD 的大小来表征，pbD 的数值越大，相应的越强；pbD 的数值越小，相应的化学键越弱。在本节，我们将比较利用从头算方经验方法得到的 NDS 状态下，各氨基酸分子中 C-N、C-O、N-H 和 O-H 化学键的（由于所采用的计算水平较高，对于分子量较大的 His、Phe、Tyr 与 Trp 分子本讨论），从而判断各分子中化学键的强弱程度，并以此为依据预测氨基酸分子发反应时的断键顺序。以甘氨酸 Gly 中的 N1-H2键为研究对象，介绍从头算的操作步骤：首先将 N1-H到 X 轴上，并把 N1原子放置在原点处，H2原子则落于（1.896 a.u.，0.000 a.u.，0.000
【参考文献】：
期刊论文
[1]3-羟基-2-丙烯醛甲基取代物的理论研究[J]. 陈铖铖,赵东霞. 科技展望. 2015(20)
[2]甲酸分子内质子转移过程的分子轮廓的动态变化[J]. 赵东霞,孔瑛杰. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2013(03)
[3]碱基分子中单电子作用势判断化学键强弱的研究[J]. 杨忠志,杜霞. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2013(03)
[4]F-+CH3Cl→CH3F+Cl-反应过程中的分子形貌变化（英文）[J]. 张明波,宫利东. 物理化学学报. 2012(05)
[5](MH)n（M=Li,Na;n=1～4）小分子团簇的分子形貌的理论研究[J]. 赵东霞,罗伦,黄艳伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2011(03)
[6]氨基酸在溶液中存在形式与pH值的关系[J]. 付彩霞. 高师理科学刊. 2010(04)
[7]离子型氢化物MH（M=Li,Na,K和Rb）的分子形貌的研究[J]. 赵东霞,黄艳伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2010(02)
[8]杂环化合物的分子形貌的研究[J]. 赵东霞,夏刚山. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2008(04)
[9]1030T恒定磁场下碱金属原子的边界轮廓[J]. 牟朝辉,赵东霞,杨忠志. 分子科学学报. 2007(05)
[10]Mn（Ⅱ）-氨基酸配合物的合成及其SOD活性[J]. 廖升荣,卢其明,刘小平,刘绍斌,乐学义. 化学研究与应用. 2006(02)
硕士论文
[1]氨基酸与银离子反应机理及氨基酸—银纳米微粒制备的研究[D]. 游玉华.贵州大学 2006
本文编号：3223749
【文章来源】：辽宁师范大学辽宁省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
H2O分子及O、H原子中单电子作用势随电子坐标的变化关系图
图 2.1 H2O 分子及 O、H 原子中单电子作用势随电子坐标的变化关系图 variation diagram of the potential acting on single electron in a molecule wielectronic coordinates in H2O molecule and atoms O and H
- 13 -图 2.3 采用 MP2/6 311 G(d,p)优化的 NDS 下 20 种氨基酸分子结构示意图g. 2.3 A schematic diagram of 20 amino acid molecules at NDS optimized by MP2/6 311 G(3.2 计算细节我们知道，化学键的强弱可以用pbD 的大小来表征，pbD 的数值越大，相应的越强；pbD 的数值越小，相应的化学键越弱。在本节，我们将比较利用从头算方经验方法得到的 NDS 状态下，各氨基酸分子中 C-N、C-O、N-H 和 O-H 化学键的（由于所采用的计算水平较高，对于分子量较大的 His、Phe、Tyr 与 Trp 分子本讨论），从而判断各分子中化学键的强弱程度，并以此为依据预测氨基酸分子发反应时的断键顺序。以甘氨酸 Gly 中的 N1-H2键为研究对象，介绍从头算的操作步骤：首先将 N1-H到 X 轴上，并把 N1原子放置在原点处，H2原子则落于（1.896 a.u.，0.000 a.u.，0.000
【参考文献】：
期刊论文
[1]3-羟基-2-丙烯醛甲基取代物的理论研究[J]. 陈铖铖,赵东霞. 科技展望. 2015(20)
[2]甲酸分子内质子转移过程的分子轮廓的动态变化[J]. 赵东霞,孔瑛杰. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2013(03)
[3]碱基分子中单电子作用势判断化学键强弱的研究[J]. 杨忠志,杜霞. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2013(03)
[4]F-+CH3Cl→CH3F+Cl-反应过程中的分子形貌变化（英文）[J]. 张明波,宫利东. 物理化学学报. 2012(05)
[5](MH)n（M=Li,Na;n=1～4）小分子团簇的分子形貌的理论研究[J]. 赵东霞,罗伦,黄艳伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2011(03)
[6]氨基酸在溶液中存在形式与pH值的关系[J]. 付彩霞. 高师理科学刊. 2010(04)
[7]离子型氢化物MH（M=Li,Na,K和Rb）的分子形貌的研究[J]. 赵东霞,黄艳伟. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2010(02)
[8]杂环化合物的分子形貌的研究[J]. 赵东霞,夏刚山. 辽宁师范大学学报(自然科学版). 2008(04)
[9]1030T恒定磁场下碱金属原子的边界轮廓[J]. 牟朝辉,赵东霞,杨忠志. 分子科学学报. 2007(05)
[10]Mn（Ⅱ）-氨基酸配合物的合成及其SOD活性[J]. 廖升荣,卢其明,刘小平,刘绍斌,乐学义. 化学研究与应用. 2006(02)
硕士论文
[1]氨基酸与银离子反应机理及氨基酸—银纳米微粒制备的研究[D]. 游玉华.贵州大学 2006
本文编号：3223749
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/huaxue/3223749.html
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