Y220C突变体影响p53C蛋白质构象转换的分子动力学模拟

发布时间：2017-07-16 23:23

  本文关键词：Y220C突变体影响p53C蛋白质构象转换的分子动力学模拟

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【摘要】：p53是迄今发现突变频率最高的一种肿瘤抑制蛋白质,突变会导致p53抑癌功能丧失并诱导癌症的发生。绝大多数的突变发生在p53的核心DNA结合区域(p53C),其中Y220C是研究较多的一种突变体。虽然已有研究表明该突变能够降低p53C的结构稳定性,但其影响p53C构象转换的分子机制尚不清晰。本文利用分子动力学(MD)模拟方法研究了p53C突变体Y220C(p53C-Y220C)的结构变化,发现Y220C突变主要影响Y220C cluster区域(包括残基138-164和215-238),且Y220C突变减少了Y220C cluster的β-折叠含量。进一步分析发现,Y220C突变不仅直接破坏突变氨基酸与周围氨基酸Leu145和Thr155之间的氢键,而且降低了Y220C cluster区域的折叠片S3和S8之间的氢键数量,使Y220C突变所形成的亲水性空腔变大,加速了水分子进入该蛋白质内部,并最终导致了p53C-Y220C变性。MD模拟结果揭示了Y220C突变影响p53C结构转换的分子机制,该研究对p53C-Y220C突变体高效稳定剂的筛选和设计具有重要意义。
【作者单位】： 天津大学化工学院生物工程系;天津科技大学海洋与环境学院;天津科技大学生物工程学院;
【关键词】： 癌症 p 残基突变 构象转换 分子动力学模拟
【基金】：国家自然科学基金(21576199)资助项目~~
【分类号】：O629.73
【正文快照】： 1引言p53是一种重要的肿瘤抑制蛋白质。p53通过与DNA或其他蛋白质(如MDM2等1)发生相互作用从而在细胞生长周期的调控、细胞分化和细胞凋亡等生命过程中发挥着重要的作用2。因此p53具有阻滞肿瘤细胞周期,促进肿瘤细胞凋亡以及抑制肿瘤血管生成等多种抑癌功能。人类p53蛋白质含

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