梳齿状类肽共聚物介观形貌的理论研究
发布时间:2017-08-15 16:07
本文关键词:梳齿状类肽共聚物介观形貌的理论研究
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【摘要】:随着生物医药研究的发展,人们对肽类和蛋白质的研究日益增多。类肽物质作为一种模拟肽,它不但具有肽类物质的优点而且可以克服肽类物质某些性质的限制,因此类肽物质得到了深入的研究和开发。目前,类肽物质的研究主要体现在结构与性能的关系、聚集行为、药物传递与释放等方面。在这些众多的研究中都离不开自组装的过程,尤其是对两亲性类肽物质的自组装过程的研究较多。实验上对这一过程的研究发挥了重要的作用。同时,在计算机模拟技术的发展下,理论研究也得到了高度的重视。理论研究不仅可以作为实验方法的一种辅助手段,而且可以对实验研究起到一定的预测和指导的作用。耗散粒子动力学(DPD)是应用于介观尺度的分子动力学模拟方法。它基手粗粒化的基本思想,成功的把原子模拟和介观模拟之间建立了联系。DPD模拟不仅形象直观,而且克服了计算机模拟在时间和空间上的限制。本论文为了提高DPD模拟的精确度,不仅通过Flory-Huggins参数的计算得到珠子间的非键相互作用参数,并且通过全原子动力学模拟计算了粗粒化分子的成键相互作用参数。本论文应用耗散粒子动力学(DPD)的方法对梳齿状类肽共聚物的自组装行为进行了理论研究。该类肽共聚物梳齿状的结构使研究更有意义。论文对Nte6-Neh30, Nte9-Neh27, Nte12-Neh24,Nte18-Neh18和Nte24-Neh12五种不同Nte质量分数的嵌段共聚物在303K、323K、343K、363K和373K五个不同温度下分别进行了DPD模拟。对模拟结果统计得到了DPD模拟的相图。模拟结果中有层状相和无序相两种形貌。我们主要采用了径向分布函数(RDF)和有序度参数(order parameter)的不同方法对结果进行了分析,并计算了层间距。同时,我们还对某一相点的层状相的形成过程进行了详细的讨论。分析发现温度、嵌段共聚物的组成比例和相互作用参数等因素对形貌的形成都有一定程度的影响。
【关键词】:类肽 嵌段共聚物 自组装 耗散粒子动力学 梳齿状
【学位授予单位】:山东大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:O631
【目录】:
- 中文摘要8-9
- Abstract9-11
- 第一章 绪论11-24
- 1.1 自组装和嵌段共聚物的研究11-14
- 1.1.1 自组装11
- 1.1.2 嵌段共聚物的研究11-14
- 1.2 类肽物质及其研究现状14-15
- 1.3 计算化学概述15-17
- 1.4 本论文的内容17-18
- 参考文献18-24
- 第二章 理论基础和分析方法的概述24-40
- 2.1 分子动力学模拟24-25
- 2.1.1 分子动力学模拟的简介24
- 2.1.2 分子动力学模拟的关键步骤24-25
- 2.2 耗散粒子动力学(Dissipative Particle Dynamics,DPD)25-29
- 2.2.1 DPD理论的起源25
- 2.2.2 DPD理论基础25-28
- 2.2.3 DPD方法的约化单位28
- 2.2.4 DPD研究的发展28
- 2.2.5 DPD特点及所用软件28-29
- 2.3 DPD应用29-32
- 2.3.1 纳米材料的研究29-30
- 2.3.2 表面活性剂的研究30
- 2.3.3 生物及医药30-31
- 2.3.4 原油的研究31-32
- 2.4 分析方法32-35
- 2.4.1 径向分布函数(Radial Distribution Function,RDF)32-33
- 2.4.2 有序参数(Order Parameter)33-35
- 参考文献35-40
- 第三章 耗散粒子动力学模型及参数计算40-55
- 3.1 粗粒化以及模型的构建40-43
- 3.2 成键相互作用参数的计算43-49
- 3.3 非键相互作用参数的计算49-50
- 3.4 其他参数的设置以及单位转换50-52
- 参考文献52-55
- 第四章 结果与讨论55-65
- 4.1 相图及其对应的形貌图55-56
- 4.2 径向分布函数(RDF)分析56-59
- 4.3 层间距的计算59
- 4.4 层状相的形成过程59-61
- 4.5 非键相互作用参数对形貌的影响61-63
- 4.6 总结63-64
- 参考文献64-65
- 第五章 本论文的创新之处与展望65-66
- 致谢66-67
- 学位论文评阅及答辩情况表67
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,本文编号:679052
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