铁皮石斛异胡豆苷合成酶基因STR序列结构及表达模式分析

发布时间：2021-12-11 23:12

　　异胡豆苷合成酶基因STR编码吲哚类生物碱合成的关键酶异胡豆苷合成酶,并参与植物抗逆和花粉发育等生物过程。本研究通过对铁皮石斛异胡豆苷合成酶基因DoSTR的结构及特异性表达进行分析,探究其在铁皮石斛生长发育中的潜在功能。从铁皮石斛基因组数据中获得铁皮石斛异胡豆苷合成酶编码序列（DoSTRs）,利用ClustalW软件进行氨基酸序列的比对,利用Gene Structure Display Server 2. 0在线软件分析基因内含子和外显子结构,利用PlantCARE数据库分析基因启动子区元件;基于转录组数据和qRT-PCR对铁皮石斛根茎叶组织、共生与非共生生长的种子和根、冷诱导和茉莉酸甲酯诱导后叶片中的STR家族基因的表达情况进行检测和分析,从铁皮石斛基因组中预测获得10个STR成员,具有典型的"Str_synth"结构域,且启动子区存在大量顺式作用元件,涉及到茉莉酸甲酯响应和低温响应等多个生物学过程;DoSTRs基因家族不同成员表达模式存在较大差异,DoSTR3、DoSTR7、DoSTR10在叶片中的表达量高于茎和根中,DoSTR9和DoSTR2在铁皮石斛种子萌发时... 

【文章来源】：生物资源. 2020,42(04)

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

铁皮石斛DoSTRs蛋白序列与其他植物中STR蛋白序列比对结果

以四年生铁皮石斛苗根、茎、叶组织为材料，以18s rDNA为内参基因（表3），进行qRT‐PCR试验，分析DoSTR家族成员在不同组织中的表达情况。试验结果如图6所示，DoSTR3、DoSTR7和DoSTR10基因在叶中的相对表达量较高，DoSTR2和DoSTR5基因在根中的相对表达量较高，DoSTR8基因在茎中的相对表达量较高。图3 铁皮石斛STR家族启动子预测

铁皮石斛STR家族启动子预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]铁皮石斛phytocyanin基因家族全基因组分析[J]. 宋争,李潞滨,梁立雄,王涛.  林业科学研究. 2018(02)
[2]胶膜菌属真菌与兰科植物的共生体系建立[J]. 许璐,田佳妮,王涛,李潞滨.  核农学报. 2017(05)
[3]铁皮石斛生物技术研究进展[J]. 张志勇,齐泽民,黄作喜.  核农学报. 2014(04)
[4]铁皮石斛实时定量PCR内参基因的筛选[J]. 张岗,赵明明,张大为,郭顺星.  中国药学杂志. 2013(19)
[5]甘蓝型油菜异胡豆苷合成酶（Strictosidine synthase）cDNA的克隆与分析[J]. 王敏培,周云涛,王茂林,赵云.  四川大学学报(自然科学版). 2008(05)



本文编号：3535571