油茶果实发育相关基因SPATULA/ALCATRAZ的鉴别

发布时间：2021-12-17 18:44

　　拟南芥（Arabidopsis thaliana）SPATULA/ALCATRAZ是与果实发育和果实大小有关的基因。对普通油茶（Camellia oleifera）幼叶、未成熟种仁、花蕾的转录组数据进行挖掘,得到2条油茶SPATULA基因序列和1条油茶ALCATRAZ基因序列;从油茶基因组三代测序数据中鉴别出含有前述3条序列的基因组DNA序列;最后,得到3条油茶SPATULA/ALCATRAZ基因全长CDS序列,分别命名为CoSPT1、CoSPT2、CoALC。用基部被子植物无油樟（Amborella trichopoda）的SPATULA及核心真双子叶植物53个SPATULA/ALCATRAZ蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoALC与拟南芥AtALC分布在不同的亚支,CoALC在油茶中的功能可能与AtALC不同,油茶蒴果的开裂机制可能与拟南芥不同;CoSPT1和CoSPT2的序列相似度只有54.57%,并且与CacuaSPT在同一个亚支,CoSPT1和CoSPT2可能是72.9～101.4百万年前Ad-β全基因组复制的产物。 

【文章来源】：南方林业科学. 2020,48(05)

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

核心真双子叶植物SPATULA/ALCATRAZ蛋白质系统进化树

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3540716