紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析
发布时间:2021-12-28 02:28
为进一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物学特性,通过RACE方法对紫娟茶树WER基因进行克隆,并使用生物信息学Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具对其序列进行分析。结果表明,WER基因全长885 bp,含有一条276 bp的完整开放阅读框,编码92个氨基酸,与番樱桃So MYB114具有较高的亲缘性;WER属于不稳定亲水蛋白,具有跨膜结构域,亚细胞定位于质膜和线粒体上,推测WER蛋白在质膜和线粒体上发挥信号转导的作用。
【文章来源】:山西农业科学. 2020,48(11)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息学分析
2 结果与分析
2.1 茶树WER基因的序列分析
2.2 WER系统进化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜区预测
2.5 WER蛋白亚细胞定位预测
2.6 WER蛋白三维结构预测
3 结论与讨论
本文编号:3553221
【文章来源】:山西农业科学. 2020,48(11)
【文章页数】:5 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息学分析
2 结果与分析
2.1 茶树WER基因的序列分析
2.2 WER系统进化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜区预测
2.5 WER蛋白亚细胞定位预测
2.6 WER蛋白三维结构预测
3 结论与讨论
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