中国莲高密度遗传图谱的构建及花瓣数控制基因的定位
发布时间:2021-12-31 17:41
莲(Nelumbo nucifera L.),又名荷花、莲花、芙蕖等,在中国栽培超过七千年。莲不仅具有食用、药用和观赏等价值,而且还是佛教的象征物。在莲花的育种研究中,杂交育种依然是培育新品种的主要方法,但是杂交育种无法在短时间内将莲花的各种优良性状集中在一起。培育出具有多种优良性状的新品种是莲花产业化的关键。现代分子育种可以结合分子标记辅助育种来提高育种效率,构建莲花极端表型的高密度遗传图是挖掘高质量分子标记的有效方法。第二代测序技术和生物信息学的发展使准确、高效地挖掘SNPs标记成为可能,同时也提高了构建遗传图谱的效率。本研究主要基于全基因组重测序的方法来构建遗传连锁图。为了定位莲花花瓣数的调控基因,本研究以中国莲多瓣品种“金秋”为父本,中国莲少瓣品种“白花建莲”为母本,构建了121株花瓣数量性状分离良好的F2代群体。利用单核苷酸多态性分子标记构建了莲花的高密度遗传图谱,定位到了一些与花瓣数性状相关的候选基因。主要结果如下:(1)本研究对121个莲花样本进行全基因组重测序,得到了704Gb的原始数据,经过筛选而得到636Gb的过滤数据。经过变异检测和遗传作图。最终构建了一个包含19...
【文章来源】:福建农林大学福建省
【文章页数】:86 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
基于全基因组重测序的区间标记分型技术流程
2.1 材料与实验方法2.1.1 实验材料本研究通过观察莲花品种花瓣数量选取中国莲多瓣品种“金秋”为父本,中国莲少瓣品种“白花建莲”为母本杂交。 “金秋”源自 2003 年引自的南京艺莲苑,中小株型,花瓣数为 124 瓣左右,为花莲,只有极少数雄蕊,雌蕊大都瓣化,雌蕊变成的花瓣多直立成一束,花开繁盛,花色淡雅,是观赏类的品种。“白花建莲”源自 1984 年中科院武汉植物研究所(现武汉植物园)的品种,为子莲、花莲兼用品种,大株型,花瓣数为 16 瓣左右,花托较大,结实率高。最终在得到 F2 群体中选取 121 株性状差异较大的个体作为群体样本来进行后续研究。两亲本花的形态如图 2-1。
.4 结果.4.1 莲花花瓣数统计结果本研究使用中国莲“金秋”作为父本,中国莲“白花建莲”作为母本杂交得 F1,F1 自交得到 F2,选取 121 株花瓣性状分离良好的 F2 代样本作为材,由于亲本白花建莲和金秋的花瓣数差异较大,在 F2 代中,统计每株莲上一定数量的花的花瓣数,取花瓣数的平均数作为性状参考。花瓣数从 1到 159 瓣分布,有性状差异。花瓣数低于 50 的样本有 89 个,高于 50 的 32 个。详细分布情况如图 2-2。经卡方检验,计算出 X2=0.12,查表可知20.05,1=3.84,X2<X20.05,1,证明表型数据符合 3:1 的分离比例。初步推测瓣可能是显性性状。详细花瓣数据见附录 A。
【参考文献】:
期刊论文
[1]EST-SSR标记构建莲(Nelumbo Adans.)遗传连锁图谱[J]. 陈岳,张微微,莫海波,付乃峰,田代科. 分子植物育种. 2017(06)
[2]孑遗和长寿命植物——莲[J]. 薛建华. 生命世界. 2015(06)
[3]QTL定位方法的研究进展[J]. 周明亮,纳巴他,张显泽,张清建,杨平贵. 草业与畜牧. 2012(05)
[4]棉花QTL定位原理、方法及研究进展[J]. 周仲华,陈金湘. 江西农业学报. 2005(04)
[5]林木遗传图谱构建研究进展[J]. 张德强,张志毅. 世界林业研究. 2002(06)
[6]莲的栽培史略[J]. 舒迎澜. 中国农史. 1988(01)
博士论文
[1]莲野生居群遗传多样性评价及高密度遗传连锁图谱的构建[D]. 刘艳玲.华中农业大学 2013
本文编号:3560691
【文章来源】:福建农林大学福建省
【文章页数】:86 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
基于全基因组重测序的区间标记分型技术流程
2.1 材料与实验方法2.1.1 实验材料本研究通过观察莲花品种花瓣数量选取中国莲多瓣品种“金秋”为父本,中国莲少瓣品种“白花建莲”为母本杂交。 “金秋”源自 2003 年引自的南京艺莲苑,中小株型,花瓣数为 124 瓣左右,为花莲,只有极少数雄蕊,雌蕊大都瓣化,雌蕊变成的花瓣多直立成一束,花开繁盛,花色淡雅,是观赏类的品种。“白花建莲”源自 1984 年中科院武汉植物研究所(现武汉植物园)的品种,为子莲、花莲兼用品种,大株型,花瓣数为 16 瓣左右,花托较大,结实率高。最终在得到 F2 群体中选取 121 株性状差异较大的个体作为群体样本来进行后续研究。两亲本花的形态如图 2-1。
.4 结果.4.1 莲花花瓣数统计结果本研究使用中国莲“金秋”作为父本,中国莲“白花建莲”作为母本杂交得 F1,F1 自交得到 F2,选取 121 株花瓣性状分离良好的 F2 代样本作为材,由于亲本白花建莲和金秋的花瓣数差异较大,在 F2 代中,统计每株莲上一定数量的花的花瓣数,取花瓣数的平均数作为性状参考。花瓣数从 1到 159 瓣分布,有性状差异。花瓣数低于 50 的样本有 89 个,高于 50 的 32 个。详细分布情况如图 2-2。经卡方检验,计算出 X2=0.12,查表可知20.05,1=3.84,X2<X20.05,1,证明表型数据符合 3:1 的分离比例。初步推测瓣可能是显性性状。详细花瓣数据见附录 A。
【参考文献】:
期刊论文
[1]EST-SSR标记构建莲(Nelumbo Adans.)遗传连锁图谱[J]. 陈岳,张微微,莫海波,付乃峰,田代科. 分子植物育种. 2017(06)
[2]孑遗和长寿命植物——莲[J]. 薛建华. 生命世界. 2015(06)
[3]QTL定位方法的研究进展[J]. 周明亮,纳巴他,张显泽,张清建,杨平贵. 草业与畜牧. 2012(05)
[4]棉花QTL定位原理、方法及研究进展[J]. 周仲华,陈金湘. 江西农业学报. 2005(04)
[5]林木遗传图谱构建研究进展[J]. 张德强,张志毅. 世界林业研究. 2002(06)
[6]莲的栽培史略[J]. 舒迎澜. 中国农史. 1988(01)
博士论文
[1]莲野生居群遗传多样性评价及高密度遗传连锁图谱的构建[D]. 刘艳玲.华中农业大学 2013
本文编号:3560691
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3560691.html
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