木薯CBL家族基因的克隆与功能分析
发布时间:2022-01-01 08:23
类似钙调磷酸酶B亚基蛋白(Calcineurin B-like proteins,CBLs)是高等植物体内主要存在的一类钙结合蛋白,它能与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(CBL-interacting protein kinase,CIPK)互作从而参与到植物的逆境响应和生长发育过程中。木薯是一种耐受非生物胁迫很好的一种材料。目前,人们对拟南芥的CBL基因及CBL-CIPK通路研究甚多,但对木薯CBL基因及其CBL-CIPK通路方面研究知之甚少。本研究从木薯中克隆CBL家族基因,利用生物信息学分析CBL蛋白的特征,利用荧光定量PCR技术研究不同胁迫下CBL基因的表达模式,并对CBL蛋白的功能进行初步研究,主要研究结果如下:1.以拟南芥的CBL蛋白序列作为query序列,从木薯基因组DNA数据库查找到序列,克隆得到木薯8个CBL基因,根据其与AtCBLs同源相似性最终分别命名为 MeCBL1、MeCBL2、MeCBL4、MeCBL5、MeCBL6、MeCBL8、MeCBL9、MeCBL10。2.利用ExPASY、CSS-Palm3.0等在线工具,发现MeCBLs蛋白分子量在24.50~28.74...
【文章来源】:海南大学海南省 211工程院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1?CBL蛋白结构示意图(Batistic?et?al.,2008)??Fig.?I?General?composition?of?CBL?protein(Batistic?et?al.,2008)??
图2拟南芥CBL家族各成员亚细胞定位模式图(董连红等,2015)??Fig.2?Subcellular?localization?pattern?of?Arabidopsis?CBLs??目前,拟南芥CBL家族各成员亚细胞定位研宄的比较多(图2)。运用绿色荧光??蛋白(GFP)融合蛋白己经发现具有短的N-末端结构域的CBL蛋白(CBL1、4、5和9)??2??
Fig.3?CIPKs?protein?composition?of?the?general?structure?(Stefan?Weinl?et?al.,2009)??CIPK在其激酶结构域之后具有自抑制结构域(NAF/FISL)?(Hrabaketal.2003)。??如图3所示,CIPKs也与其他激酶一样,在活化环内有催化结构域,而它的调节结构??域被分成NAF/FISL区域和蛋白隣酸酶互作区域(Protein-Phosphatase?interaction,PPI)??(Batisticetal.,2009)。PPI主要负责CIPKs与2C型蛋白磷酸酶之间的相互作用。CIPKs??蛋白的自抑制区域(NAF/FISL),该区域由24个氨基酸组成,主要结合CBLs,消除自??身的抑制作用,促使CIPKs与CBLs相互作用(Hrabaketal.,2003),但其序列的可变性??较大,因此也决定了二者之间的特异性互作。NAF具有疏水性,表明CBL蛋白与CIPK??蛋白的互作是靠疏水性作用力实现的(Kim?etal.,2000;?Albrecht?etal.,?2001)。NAF??结构域对CIPK蛋白的激酶活性还具有抑制作用(Batisticetal.,2004),当NAF调节??域缺失时
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物CBL基因家族的研究进展[J]. 董连红,史素娟,S M Nuruzzaman Manik,苏玉龙,刘朝科,冯祥国,胡晓明,王倩,刘好宝. 核农学报. 2015(05)
[2]植物体内钙信号及其在调节干旱胁迫中的作用[J]. 刘小龙,李霞,钱宝云,唐玉婷. 西北植物学报. 2014(09)
[3]ABA与植物胁迫抗性[J]. 吴耀荣,谢旗. 植物学通报. 2006(05)
本文编号:3561989
【文章来源】:海南大学海南省 211工程院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1?CBL蛋白结构示意图(Batistic?et?al.,2008)??Fig.?I?General?composition?of?CBL?protein(Batistic?et?al.,2008)??
图2拟南芥CBL家族各成员亚细胞定位模式图(董连红等,2015)??Fig.2?Subcellular?localization?pattern?of?Arabidopsis?CBLs??目前,拟南芥CBL家族各成员亚细胞定位研宄的比较多(图2)。运用绿色荧光??蛋白(GFP)融合蛋白己经发现具有短的N-末端结构域的CBL蛋白(CBL1、4、5和9)??2??
Fig.3?CIPKs?protein?composition?of?the?general?structure?(Stefan?Weinl?et?al.,2009)??CIPK在其激酶结构域之后具有自抑制结构域(NAF/FISL)?(Hrabaketal.2003)。??如图3所示,CIPKs也与其他激酶一样,在活化环内有催化结构域,而它的调节结构??域被分成NAF/FISL区域和蛋白隣酸酶互作区域(Protein-Phosphatase?interaction,PPI)??(Batisticetal.,2009)。PPI主要负责CIPKs与2C型蛋白磷酸酶之间的相互作用。CIPKs??蛋白的自抑制区域(NAF/FISL),该区域由24个氨基酸组成,主要结合CBLs,消除自??身的抑制作用,促使CIPKs与CBLs相互作用(Hrabaketal.,2003),但其序列的可变性??较大,因此也决定了二者之间的特异性互作。NAF具有疏水性,表明CBL蛋白与CIPK??蛋白的互作是靠疏水性作用力实现的(Kim?etal.,2000;?Albrecht?etal.,?2001)。NAF??结构域对CIPK蛋白的激酶活性还具有抑制作用(Batisticetal.,2004),当NAF调节??域缺失时
【参考文献】:
期刊论文
[1]植物CBL基因家族的研究进展[J]. 董连红,史素娟,S M Nuruzzaman Manik,苏玉龙,刘朝科,冯祥国,胡晓明,王倩,刘好宝. 核农学报. 2015(05)
[2]植物体内钙信号及其在调节干旱胁迫中的作用[J]. 刘小龙,李霞,钱宝云,唐玉婷. 西北植物学报. 2014(09)
[3]ABA与植物胁迫抗性[J]. 吴耀荣,谢旗. 植物学通报. 2006(05)
本文编号:3561989
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3561989.html
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