NSCLC的基因表达谱分析及miR210HG在NSCLC发病机制中的作用
发布时间:2022-01-06 18:16
目的:通过NSCLC静脉血基因测序及细胞实验为NSCLC寻找诊断及治疗的潜在靶点,探讨LncRNA-miR210HG在NSCLC中的潜在作用。方法:该实验采用单盲法,收集2019年就诊于新疆医科大学肿瘤医院的NSCLC患者及门诊体检的健康人抽取外周静脉血,通过RNA提取及对lncRNA及miRNA测序寻找显著差异基因,进行GO及KEGG分析。同时对体外NSCLC细胞通过沉默LncRNA-miR210HG对比前后miR210、HIF-1α、VEGF的表达水平差异。结果:通过对NSCLC患者及健康人外周静脉血lncRNA及miRNA测序发现,804个lncRNAs和2298个mRNAs差异表达(倍数变化LncRNA 2.0,P<0.0 5)。NSCLC外周血中425个lncRNAs和1013个miRNAs表达上调,379个lncRNAs和1285个mRNAs表达下调。lncRNAs显著上调的有MIAT、LINC02193、LINC02446等,显著下调的有LINC01503、LINC00667、LINC01336等,涉及通路包括癌症中的类属转录、基因表达、信号转导、cAMP信号通路、...
【文章来源】:新疆医科大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(A)NSCLC组与健康对照组静脉血差异的lncRNAs分布聚类图;(B)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的lncRNAs火山图(C)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的mRNAs分布聚类图;(D)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的mRNAs火山图;
结合或ATP水解酶活性等;生物学途径,指分子功能的有序组合,达成更广的生物功能,如有丝分裂或嘌呤代谢等。GO分析表明,1028个预测的靶基因之间存在大量的功能重叠,其中包括800个上调mRNA和228个下调mRNA。生物过程、分子功能和细胞成分此外,它们还富含生物过程,包括细胞成分组织或生物遗传、代谢过程、细胞增长、刺激反应、细胞杀伤等;在细胞成分中包括细胞内、细胞间、细胞质、细胞器部分、细胞功能、病毒核心、分子复合物、细胞外基质等;在分子功能中包括蛋白组合转录因子活性、化学引物活动和整合等,(P<0.01)(图2)。图2基因本体(GO)富集分析长非编码RNA(LncRNAs)靶基因(mRNAs)。x轴代表GO术语,包括生物过程(蓝色)、细胞成分(绿色)和分子功能(红色),而y轴包括三个部分,左边表示基因
新疆医科大学硕士学位论文22C图4:nc为空白对照组,(A):加入miR210mimic、inhibitor后miR210表达量;(B):加入miR210inhibitor后HIF、VEGF、miR210HG的表达量;(C)miR210mimic后HIF-1α、VEGF、miR210HG的表达量。(5)在NSCLCH1650细胞中,加入miR210HG抑制物使(miR210HGinhibitor)miR210HG表达抑制后,HIF与VEGF的表达明显降低,miR210的表达明显增加(图6)。图6:nc为空白对照组,2243代表miR210HG支链。
【参考文献】:
期刊论文
[1]长链非编码RNA-H19特异性吸附微RNA-760调控nanog基因表达促进非小细胞肺癌细胞增殖和迁移[J]. 李莎,朱怡卿,石荟,戈霞晖,许靖,商艳,王芳,白冲. 第二军医大学学报. 2019(08)
[2]长链非编码RNA PVT1对非小细胞肺癌细胞增殖和迁移能力的影响及其机制研究[J]. 张双美,王斌,陈怡,张小火,施雪霏. 中华全科医学. 2019(06)
[3]长链非编码RNA DLX6-AS1在非小细胞肺癌中的表达及其作用研究[J]. 朱多杰,王成,李斌,蒋鹏,杨建宝,宋铁牛,魏小平,孟于琪. 重庆医学. 2019(03)
本文编号:3572937
【文章来源】:新疆医科大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
(A)NSCLC组与健康对照组静脉血差异的lncRNAs分布聚类图;(B)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的lncRNAs火山图(C)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的mRNAs分布聚类图;(D)NSCLC组与健康对照组患者静脉血差异的mRNAs火山图;
结合或ATP水解酶活性等;生物学途径,指分子功能的有序组合,达成更广的生物功能,如有丝分裂或嘌呤代谢等。GO分析表明,1028个预测的靶基因之间存在大量的功能重叠,其中包括800个上调mRNA和228个下调mRNA。生物过程、分子功能和细胞成分此外,它们还富含生物过程,包括细胞成分组织或生物遗传、代谢过程、细胞增长、刺激反应、细胞杀伤等;在细胞成分中包括细胞内、细胞间、细胞质、细胞器部分、细胞功能、病毒核心、分子复合物、细胞外基质等;在分子功能中包括蛋白组合转录因子活性、化学引物活动和整合等,(P<0.01)(图2)。图2基因本体(GO)富集分析长非编码RNA(LncRNAs)靶基因(mRNAs)。x轴代表GO术语,包括生物过程(蓝色)、细胞成分(绿色)和分子功能(红色),而y轴包括三个部分,左边表示基因
新疆医科大学硕士学位论文22C图4:nc为空白对照组,(A):加入miR210mimic、inhibitor后miR210表达量;(B):加入miR210inhibitor后HIF、VEGF、miR210HG的表达量;(C)miR210mimic后HIF-1α、VEGF、miR210HG的表达量。(5)在NSCLCH1650细胞中,加入miR210HG抑制物使(miR210HGinhibitor)miR210HG表达抑制后,HIF与VEGF的表达明显降低,miR210的表达明显增加(图6)。图6:nc为空白对照组,2243代表miR210HG支链。
【参考文献】:
期刊论文
[1]长链非编码RNA-H19特异性吸附微RNA-760调控nanog基因表达促进非小细胞肺癌细胞增殖和迁移[J]. 李莎,朱怡卿,石荟,戈霞晖,许靖,商艳,王芳,白冲. 第二军医大学学报. 2019(08)
[2]长链非编码RNA PVT1对非小细胞肺癌细胞增殖和迁移能力的影响及其机制研究[J]. 张双美,王斌,陈怡,张小火,施雪霏. 中华全科医学. 2019(06)
[3]长链非编码RNA DLX6-AS1在非小细胞肺癌中的表达及其作用研究[J]. 朱多杰,王成,李斌,蒋鹏,杨建宝,宋铁牛,魏小平,孟于琪. 重庆医学. 2019(03)
本文编号:3572937
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