西瓜WRKY家族基因分析及低温响应WRKY基因功能鉴定
发布时间：2022-01-06 21:24
西瓜（Citrullus lanatus）是世界范围内广泛种植的重要园艺作物,在早春露地栽培以及反季节设施栽培中常常遭遇低温胁迫。研究西瓜在低温胁迫下的基因表达模式,鉴定差异表达基因的功能,有助于进一步了解西瓜低温响应及调控机制,为西瓜耐低温遗传改良提供理论支撑和基因资源。WRKY转录因子家族成员数量多且具有重要功能,不仅影响植物生长发育过程,还能够对植物面临的各种胁迫产生响应并发挥调控作用。低温胁迫下的西瓜转录组数据分析结果显示,多个WRKY家族基因的表达模式发生了显著改变,表明WRKY能够响应低温胁迫,但这些基因是否具有调控西瓜耐低温的功能,目前尚不清楚。针对这一问题,本研究在分析西瓜WRKY基因家族特征的基础上,鉴定了2个受低温胁迫诱导显著上调表达的WRKY基因Cla018059和Cla021170的功能,获得了以下研究结果:1.西瓜WRKY转录因子家族鉴定和特征分析。利用隐马尔可夫模型,在西瓜基因组上鉴定出57个WRKY转录因子家族成员,根据家族成员在染色体上的位置,依次命名为ClWRKY1ClWRKY57。蛋白序列比对及系统发生分析表明,57个ClWRK...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
西瓜ClWRKY转录因子各族WRKY保守结构域序列特征
图 3 拟南芥 AtWRKY 与西瓜 ClWRKY 蛋白的系统发育树Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins.1.3 西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因结构分析用GSDS 2.0工具绘制了西瓜ClWRKY 转录因子家族的基因结构图，结果见图基因序列全长来看，57 个 ClWRKY 家族成员的全长序列在 0.7 kb~7 kb 之间。显子数量上来看，西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因的外显子数量在 2~6 个之间中以外显子数量为 3 个的 ClWRKY 家族成员最多，有 27 个；外显子数量为 4 个lWRKY 家族成员数量次之，有 10 个；外显子数量为 2 个的 ClWRKY 家族成员有；外显子数量为 5 个的 ClWRKY 家族成员有 7 个；外显子数量为 6 个的 ClWR族成员最少，仅有 3 个。从亚族上来看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外显子数量 4，其中以含 4 个外显子的成员最多；其它亚族成员外显子数量 2~3 个，含 3 个
Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins3.1.3 西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因结构分析用GSDS 2.0工具绘制了西瓜ClWRKY 转录因子家族的基因结构图，结果见图4。从基因序列全长来看，57 个 ClWRKY 家族成员的全长序列在 0.7 kb~7 kb 之间。从外显子数量上来看，西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因的外显子数量在 2~6 个之间，其中以外显子数量为 3 个的 ClWRKY 家族成员最多，有 27 个；外显子数量为 4 个的ClWRKY 家族成员数量次之，有 10 个；外显子数量为 2 个的 ClWRKY 家族成员有 8个；外显子数量为 5 个的 ClWRKY 家族成员有 7 个；外显子数量为 6 个的 ClWRKY家族成员最少，仅有 3 个。从亚族上来看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外显子数量 4~6个
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物活性氧的产生及其作用和危害[J]. 张梦如,杨玉梅,成蕴秀,周滔,段晓艳,龚明,邹竹荣. 西北植物学报. 2014(09)
[2]超氧化物歧化酶（SOD）的应用研究进展[J]. 董亮,何永志,王远亮,董志扬. 中国农业科技导报. 2013(05)
[3]植物在低温胁迫下的过氧化氢代谢及信号转导[J]. 刘零怡,赵丹莹,郑杨,申琳,生吉萍. 园艺学报. 2009(11)
[4]植物超氧化物歧化酶（SOD）的研究进展[J]. 马旭俊,朱大海. 遗传. 2003(02)
[5]植物过氧化物酶研究进展[J]. 田国忠,李怀方,裘维蕃. 武汉植物学研究. 2001(04)
[6]西瓜幼苗耐低温研究初报[J]. 许勇,王永健,张峰,张丽蓉. 华北农学报. 1997(02)
硕士论文
[1]西瓜对低温、弱光及其双重胁迫的响应分析[D]. 韩兰兰.华中农业大学 2016
[2]不同烤烟品种抗寒性及相关生理生化指标的研究[D]. 陈卫国.湖南农业大学 2007
本文编号：3573194
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
西瓜ClWRKY转录因子各族WRKY保守结构域序列特征
图 3 拟南芥 AtWRKY 与西瓜 ClWRKY 蛋白的系统发育树Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins.1.3 西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因结构分析用GSDS 2.0工具绘制了西瓜ClWRKY 转录因子家族的基因结构图，结果见图基因序列全长来看，57 个 ClWRKY 家族成员的全长序列在 0.7 kb~7 kb 之间。显子数量上来看，西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因的外显子数量在 2~6 个之间中以外显子数量为 3 个的 ClWRKY 家族成员最多，有 27 个；外显子数量为 4 个lWRKY 家族成员数量次之，有 10 个；外显子数量为 2 个的 ClWRKY 家族成员有；外显子数量为 5 个的 ClWRKY 家族成员有 7 个；外显子数量为 6 个的 ClWR族成员最少，仅有 3 个。从亚族上来看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外显子数量 4，其中以含 4 个外显子的成员最多；其它亚族成员外显子数量 2~3 个，含 3 个
Fig.3 Phylogenetic tree of arabidopsis AtWRKY and Watermelon ClWRKY proteins3.1.3 西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因结构分析用GSDS 2.0工具绘制了西瓜ClWRKY 转录因子家族的基因结构图，结果见图4。从基因序列全长来看，57 个 ClWRKY 家族成员的全长序列在 0.7 kb~7 kb 之间。从外显子数量上来看，西瓜 ClWRKY 转录因子家族基因的外显子数量在 2~6 个之间，其中以外显子数量为 3 个的 ClWRKY 家族成员最多，有 27 个；外显子数量为 4 个的ClWRKY 家族成员数量次之，有 10 个；外显子数量为 2 个的 ClWRKY 家族成员有 8个；外显子数量为 5 个的 ClWRKY 家族成员有 7 个；外显子数量为 6 个的 ClWRKY家族成员最少，仅有 3 个。从亚族上来看，I 族、IIa 族和 IIb 族的外显子数量 4~6个
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物活性氧的产生及其作用和危害[J]. 张梦如,杨玉梅,成蕴秀,周滔,段晓艳,龚明,邹竹荣. 西北植物学报. 2014(09)
[2]超氧化物歧化酶（SOD）的应用研究进展[J]. 董亮,何永志,王远亮,董志扬. 中国农业科技导报. 2013(05)
[3]植物在低温胁迫下的过氧化氢代谢及信号转导[J]. 刘零怡,赵丹莹,郑杨,申琳,生吉萍. 园艺学报. 2009(11)
[4]植物超氧化物歧化酶（SOD）的研究进展[J]. 马旭俊,朱大海. 遗传. 2003(02)
[5]植物过氧化物酶研究进展[J]. 田国忠,李怀方,裘维蕃. 武汉植物学研究. 2001(04)
[6]西瓜幼苗耐低温研究初报[J]. 许勇,王永健,张峰,张丽蓉. 华北农学报. 1997(02)
硕士论文
[1]西瓜对低温、弱光及其双重胁迫的响应分析[D]. 韩兰兰.华中农业大学 2016
[2]不同烤烟品种抗寒性及相关生理生化指标的研究[D]. 陈卫国.湖南农业大学 2007
本文编号：3573194
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3573194.html
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