超突变结直肠癌预后预测基因模型的建立
发布时间:2022-01-07 13:49
目的:结直肠癌作为发病率稳居前列的癌种,根据基因组突变负荷高低可分为超突变和非超突变两类。文献报道发生超突变的患者比例可达15-17%,故此类患者的总人数不容小觑。越来越多的研究和临床实践发现,发生超突变的结直肠癌患者与未发生超突变的患者在临床病理特征、生存预后及治疗方式上均存在明显差异,尤其在传统化疗中,发生超突变的结直肠癌患者获益有限,但其有较大可能从免疫治疗中获益。方法:收集浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所(ZJU)中随访超过24个月的患者术后的结直肠癌标本进行二代测序,选出其中超突变的患者,将该部分患者作为训练集,运用R语言(3.6.0)及Python(3.4.0)进行加权运算,建立一个预测患者预后的模型,将超突变结直肠癌患者分为高危组和低危组。最后,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取匹配的人群作为独立的验证集,验证得到基因预测模型,并合并所有患者展示最终的结果。结果:研究最终入组45例来自本中心(ZJU)的患者及24例来自TCGA数据库的患者,建立一个包含四个基因(ACVR2A、APC、DOCK2和POLE)的用于预测超突变结直肠癌患者预后的模型。高危组患者的术后总...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
DNA测序流程图
浙江大学硕士学位论文?正文结果??亚组中可以区分患者危险度,且高危组患者与较差的预后明显相关(HR?==丨2.57??95%CI:?1.57-100.69,尸=?0.002;图?3.3C)。??表3.2运用多因素COX回归模型校正四基因模型??HR?(95%?CI)?尸值??四基因模型?9.85?(2.07-46.81)?0.004??年龄?1.02?(0.98-1.06)?0.442??性别?2.49?(0.82-7.56)?0.108??TNM?分期?0.65?(0.28-1.49)?0.307??Distribution?of?10000?permutation?results??(TCGA?hypermutated?cohort)??
Overall?Survival?(months)??No.?at?risk:??Htgh?risk?22?19?13?12?7?2?1??Low?risk?28?27?27?16?8?3?3??
本文编号:3574662
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
DNA测序流程图
浙江大学硕士学位论文?正文结果??亚组中可以区分患者危险度,且高危组患者与较差的预后明显相关(HR?==丨2.57??95%CI:?1.57-100.69,尸=?0.002;图?3.3C)。??表3.2运用多因素COX回归模型校正四基因模型??HR?(95%?CI)?尸值??四基因模型?9.85?(2.07-46.81)?0.004??年龄?1.02?(0.98-1.06)?0.442??性别?2.49?(0.82-7.56)?0.108??TNM?分期?0.65?(0.28-1.49)?0.307??Distribution?of?10000?permutation?results??(TCGA?hypermutated?cohort)??
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