嗜麦芽窄食单胞菌随机扩增多态性DNA基因分型及同源性分析

发布时间：2022-01-10 13:03

　　目的采用一种快速,准确的基因分型方法,针对嗜麦芽窄食单胞菌导致的医院内感染进行流行病学调查,为预防院内交叉感染提供理论依据。方法收集南京市某医院住院患者痰液样本,并分离嗜麦芽窄食单胞菌,采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术获得指纹图谱,并利用SAS9.2软件对其进行聚类分析。结果 39株嗜麦芽窄食单胞菌菌株根据其DNA条带聚类分析,可分为A、B、C、D、E、F和G 7个型,A、B、D、E均有2个亚型,其中A型为优势型别。同源性分析结果表明在神经内科与呼吸内科,ICU与呼吸内科分别有同一克隆株的传播,科室之间可能存在交叉感染。结论 RAPD是一种简单快速,低成本的基因分型方法,适合临床病原菌的分型及医院感染分子流行病学研究。 

【文章来源】：中国卫生检验杂志. 2020,30(20)

【文章页数】：3 页

【部分图文】：

RAPD琼脂糖凝胶电泳图谱

聚类分析结果中确定分类个数的指标有CCC(立方聚类准则值)、PSF (伪F统计量)和PST2 (伪t2统计量)。CCC的峰值表示建议聚类数，本例中，当分为7类时，CCC达到峰值;伪F值描述的是当前情况下，类与类之间的分离程度，该值越大则聚类效果越好，在聚类数1～7，当伪F值最大，聚类数为7;伪t2越大，说明本次聚类效果不好，应返回上一次合并，当聚类数为7时，伪t2较小。综合分析，用average法，给39株嗜麦芽窄食单胞菌分为7类时比较合适(图2)，即A、B、C、D、E、F和G型，其中A、B、D、E型均有2个亚型。A型14株，包括A18株，A26株，B型11株，包括B19株，B22株，C型3株，D型4株，包括D12株，D22株，E型3株，包括E12株，E21株，F型2株，G型2株。3 讨论


本文编号：3580766