甘蓝型油菜控制主花序和主茎伸长速率的关键基因筛选
发布时间：2022-01-20 18:11
株高是甘蓝型油菜理想株型和高产量的重要因素之一,而主花序长度和主茎长度（茎高）是株高的重要组成部分。生产实践表明,在株高一定的前提下,较长主花序和较短的主茎是高产的基础。主花序和主茎在蕾苔期和花期的伸长速率与最终长度的关系是本研究的重点,将株高分解为2个性状,再分解到不同发育时期进行研究是本研究的创新点。本研究1)利用588份自然群体重测序获得SNP数据,对连续两年的主花序伸长速率和主茎伸长速率进行全基因组关联分析,筛选与主花序伸长速率和主茎伸长速率显著关联的SNP标记;2)利用189份重组自交系群体构建高密度连锁遗传图谱,对连续两年的主花序伸长速率和主茎伸长速率进行QTL定位;3)筛选主花序伸长速率和主茎伸长速率的差异极端材料测定不同阶段的激素含量;4)极端材料转录组测序,结合GWAS和QTL结果筛选与主花序伸长速率和主茎伸长速率相关的候选基因。主要研究结果如下:1.主花序长和茎高及其伸长速率的表型情况主花序长度在2018年和2019年重组自交系群体中6次不同时期测量的平均数及变异系数分别为9.86 cm52.27 cm和4.13%26.9...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图4.1两群体主花序长和茎高的频次分布
第4章结果与分析21图4.2两群体主花序伸长速率和主茎伸长速率的频次分布Figure4.2FrequencydistributionofmaininflorescenceelongationrateandthemainstemelongationrateintwopopulationsMIER：主花序伸长速率；MSER：主茎伸长速率；RIL：重组自交系；N：自然群体MIER:maininflorescenceselongationrate;MSER:mainstemelongationrate;RIL:recombinantinbredlines;N:naturalpopulation
第4章结果与分析29图4.3主花序伸长速率和主茎伸长速率QTL位点在SNP连锁群上分布情况Figure4.3PutativeQTLlocationsofmaininflorescenceelongationrateandthemainstemelongationrateontheSNPgeneticmap4.3自然群体全基因组关联分析对两年两性状所有时期的伸长速率在6种关联分析模型下绘制Quantile-quantile图，将各模型下的曲线与期望曲线拟合度最高的模型作为最佳模型；共有6个时期检测到显著关联的SNP位点（图4.5）（附表1），由图4.4可知，所有性状的最佳模型均为P+K模型。主花序伸长速率在2018、2019年最佳模型下分别检测到62和8个显著性位点（P<1/385692），这些显著性位点分布在A03（25个）、A07（18个）、A09（4个）、C03（2个）、C04（2个）、C06（2个）、C08（15个）和C09（2个）染色体上，其表型贡献率为9.5%~27.7%，其中A07染色体上的S7_16388885位点在两年
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝型油菜主花序性状全基因组关联分析[J]. 韩德鹏,周灿,郑伟,李亚贞,付东辉,周庆红. 核农学报. 2018(03)
[2]甘蓝型油菜结角高度与荚层厚度的全基因组关联分析[J]. 卢坤,王腾岳,徐新福,唐章林,曲存民,贺斌,梁颖,李加纳. 作物学报. 2016(03)
[3]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析[J]. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 作物学报. 2015(07)
[4]甘蓝型油菜株高、第一分枝高和分枝数的QTL检测及候选基因筛选[J]. 王嘉,荆凌云,荐红举,曲存民,谌利,李加纳,刘列钊. 作物学报. 2015(07)
[5]利用高密度SNP标记定位甘蓝型油菜株高QTL[J]. 张凤启,刘越英,程晓辉,童超波,董彩华,唐敏强,黄军艳,刘胜毅. 中国油料作物学报. 2014(06)
[6]油菜株型育种研究进展[J]. 曾川,刘成家,徐洪志,黄涌,伊淑丽. 中国农学通报. 2014(12)
[7]玉米理想株型研究进展[J]. 贾波,谢庆春,倪向群. 江西农业学报. 2012(04)
[8]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[9]紧凑型油菜数量性状的遗传与杂种优势研究[J]. 王俊生,张文学,田建华,李殿荣. 西北农业学报. 2006(03)
[10]运用混合线性模型定位复杂数量性状基因的方法[J]. 朱军. 浙江大学学报(自然科学版). 1999(03)
博士论文
[1]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[2]甘蓝型油菜株高和开花时间的QTL定位及黄籽性状的分子标记[D]. 梅德圣.中国农业科学院 2005
硕士论文
[1]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[2]甘蓝型油菜主花序长度和茎高相关基因的定位分析[D]. 张莉.西南大学 2018
[3]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[4]甘蓝型油菜含油量性状全基因组关联分析[D]. 段继凤.华中农业大学 2013
[5]甘蓝型油菜主要株型性状的遗传分析和QTL初步定位[D]. 张倩.西南大学 2013
[6]甘蓝型油菜一次分枝数的通径分析、遗传特性及QTL初步定位[D]. 宋稀.中国农业科学院 2012
[7]甘蓝型油菜抗倒伏相关性状的遗传分析和QTL定位[D]. 张文华.华中农业大学 2010
本文编号：3599286
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图4.1两群体主花序长和茎高的频次分布
第4章结果与分析21图4.2两群体主花序伸长速率和主茎伸长速率的频次分布Figure4.2FrequencydistributionofmaininflorescenceelongationrateandthemainstemelongationrateintwopopulationsMIER：主花序伸长速率；MSER：主茎伸长速率；RIL：重组自交系；N：自然群体MIER:maininflorescenceselongationrate;MSER:mainstemelongationrate;RIL:recombinantinbredlines;N:naturalpopulation
第4章结果与分析29图4.3主花序伸长速率和主茎伸长速率QTL位点在SNP连锁群上分布情况Figure4.3PutativeQTLlocationsofmaininflorescenceelongationrateandthemainstemelongationrateontheSNPgeneticmap4.3自然群体全基因组关联分析对两年两性状所有时期的伸长速率在6种关联分析模型下绘制Quantile-quantile图，将各模型下的曲线与期望曲线拟合度最高的模型作为最佳模型；共有6个时期检测到显著关联的SNP位点（图4.5）（附表1），由图4.4可知，所有性状的最佳模型均为P+K模型。主花序伸长速率在2018、2019年最佳模型下分别检测到62和8个显著性位点（P<1/385692），这些显著性位点分布在A03（25个）、A07（18个）、A09（4个）、C03（2个）、C04（2个）、C06（2个）、C08（15个）和C09（2个）染色体上，其表型贡献率为9.5%~27.7%，其中A07染色体上的S7_16388885位点在两年
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝型油菜主花序性状全基因组关联分析[J]. 韩德鹏,周灿,郑伟,李亚贞,付东辉,周庆红. 核农学报. 2018(03)
[2]甘蓝型油菜结角高度与荚层厚度的全基因组关联分析[J]. 卢坤,王腾岳,徐新福,唐章林,曲存民,贺斌,梁颖,李加纳. 作物学报. 2016(03)
[3]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析[J]. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 作物学报. 2015(07)
[4]甘蓝型油菜株高、第一分枝高和分枝数的QTL检测及候选基因筛选[J]. 王嘉,荆凌云,荐红举,曲存民,谌利,李加纳,刘列钊. 作物学报. 2015(07)
[5]利用高密度SNP标记定位甘蓝型油菜株高QTL[J]. 张凤启,刘越英,程晓辉,童超波,董彩华,唐敏强,黄军艳,刘胜毅. 中国油料作物学报. 2014(06)
[6]油菜株型育种研究进展[J]. 曾川,刘成家,徐洪志,黄涌,伊淑丽. 中国农学通报. 2014(12)
[7]玉米理想株型研究进展[J]. 贾波,谢庆春,倪向群. 江西农业学报. 2012(04)
[8]数量性状基因的完备区间作图方法[J]. 王建康. 作物学报. 2009(02)
[9]紧凑型油菜数量性状的遗传与杂种优势研究[J]. 王俊生,张文学,田建华,李殿荣. 西北农业学报. 2006(03)
[10]运用混合线性模型定位复杂数量性状基因的方法[J]. 朱军. 浙江大学学报(自然科学版). 1999(03)
博士论文
[1]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[2]甘蓝型油菜株高和开花时间的QTL定位及黄籽性状的分子标记[D]. 梅德圣.中国农业科学院 2005
硕士论文
[1]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[2]甘蓝型油菜主花序长度和茎高相关基因的定位分析[D]. 张莉.西南大学 2018
[3]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[4]甘蓝型油菜含油量性状全基因组关联分析[D]. 段继凤.华中农业大学 2013
[5]甘蓝型油菜主要株型性状的遗传分析和QTL初步定位[D]. 张倩.西南大学 2013
[6]甘蓝型油菜一次分枝数的通径分析、遗传特性及QTL初步定位[D]. 宋稀.中国农业科学院 2012
[7]甘蓝型油菜抗倒伏相关性状的遗传分析和QTL定位[D]. 张文华.华中农业大学 2010
本文编号：3599286
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