伴t（1;19）（q23;p13）/E2A-PBX1融合基因成人急性B淋巴细胞白血病患者临床与分子遗传学特征研究
发布时间：2022-01-24 17:22
[目的]1.研究伴t（1;19）（q23;p13）/E2A-PBX1融合基因成人急性B淋巴细胞白血病患者临床特征,分析不同治疗方式对疾病预后的影响。2.探索伴t（1;19）（q23;p13）/E2A-PBX1融合基因成人急性B淋巴细胞白血病基因表达谱,并探究该病的发生机制。[方法]1.回顾性分析了本中心诊治的43例伴t（1;19）（q23;p1 3）/E2A-PBX1融合基因的成人急性B淋巴细胞白血病患者的临床资料、治疗反应及预后情况。2.收集本中心23例伴t（1;19）（q23;p13）/E2A-PBX1融合基因成人急性B淋巴细胞白血病患者初诊、完全缓解及复发时期的骨髓标本,通过高通量测序（NGS及WES）了解其基因分布,筛选出可能的与E2A-PBX1协同致病的基因。利用PyClone软件及ClonEvol软件分析亚克隆类型,推断克隆进化模型,并绘制进化树。[结果]1.在43例伴t（1;19）（q23;p13）/E2A-PBX1融合基因成人急性B淋巴细胞白血病患者中,男性20人,女性23人,中位年龄26岁（16-85岁）。9例患者仅存在t（1;19）（q23;p13）染色体异常,5例...
【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图５．?ＷＥＳ检测生物信息学分析流程图??１１）克隆演变??本研究克隆演变模型预测由至上海欧易生物公司协作完成
?０１８??ｉｌｌ?■?＿?－?ｍＳ?＾ｏｌｏ?°〇］ｌ??Ｉ６?－?画?ＭＴＯＲ?Ｊｉ?驗００５??ｏ?１４３?麵?ＭＹＣ?０２８?Ｍｆｒａｍｅｓｈｉｆｔ??ｓ?ｉｔｉ?＿＝?盟ｒ?雜?Ｓｍ＿ｓｅ??〇?２８?６?ｍｍ?ｍｍ?Ｄ＇Ｃｅｒｉ?ｏｏｒ?Ｕｓｐｕｃｉｎｇ??Ｓ?－Ｉ?Ｆｐ°ｔ＾３?§§５?篇?ＳＴ〇Ｐ＿＿ｅＤ??＊ｒｙ（ｊ?ｍｍ?靈－＞Ａ?－＞ＣＴＧＡ〇ＧＴＣ?－＞〇?＞Ｔ??ｆ?｜ｉ＼ｉｉ｜ｉＬｉ?ｉｉｉｉ＾ｉ：ｉｉＥ?：ｓ：：－??图６．?２３例伴ｔ（ｌ；１９）（ｑ２３；ｐｌ３）／Ｅ２Ａ－ＰＢＸｌ融合基因Ｂ－ＡＬＬ患者基因突变图谱??３．３?Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１＋?Ｂ－ＡＬＬ?ＷＥＳ?检测结果分析??本研宄中共有９例患者收集到相对应的ＣＲ期标本，予送检ＷＥＳ测序。在对９??例行ＷＥＳ检测患者标本深入分析后发现，５例患者（５／９，５５．６％）合并有泛素化相??关基因?ＣＤＣ２７?（３／９，３３＿３％）、ＵＳＰ４０?（２／９，２２．２％）、ＵＳＰ５?（２／９，２２．２％）的突变。其??具体突变位点见表９。而２４号病人（Ｐ２４）和３９号病人（Ｐ３９）都存在ＵＳＰ５突变，??且有相同突变位点。针对ＵＳＰ５发生的突变位点进行功能预测发现，ｃ．２２２２Ｃ＞Ａ??（ｐ．Ａｌａ７４ｌＡｓｐ）突变位于多物种的氨基酸保守序列，Ａ７４１是ＵＣＨ结构域中３－螺旋束??至关重要的氨基酸残基，通过疏水作用稳定螺旋束结构，该突变能够改变ＵＣＨ结构??域，导致了?ＵＳＰ５泛素结合能力减弱；而ｃ．２７２ｄｅｌＣ（ｐ．Ｐｒｏ９１Ｈｉｓｆｓ）为框移突变，使ＵＳＰ５??提前出现了终止密码子，从而导致ＵＳＰ５彻底失去功
第二部分?伴ｔ（ｌ：１９）（ｑ２３：ｐｌ３）／Ｅ２Ａ－ＰＢＸｌ融合基因成人急性Ｂ淋巴细胞白血病患者临床与分子遗传学特征研究??在Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因致白血病过程中的作用，本研究选取了人源Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合??基因阳性的Ｂ－ＡＬＬ细胞株６９７、ＫＡＳＵＭＩ，检测其ＵＳＰ５、Ｐ５３、Ｍｄｍ２、Ｐ２１以及??Ｂａｘ的表达，并选取ＢＶ－１７３、ＪＥＫ０－１两株人源Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因阴性的Ｂ－ＡＬＬ??细胞株作为对照。可见在Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因阳性细胞株中，ＵＳＰ５ｍＲＮＡ表达量降??低，而Ｐ５３和Ｐ２１ｍＲＮＡ表达量也降低（图８）。??ｕｂｉｑｕｍ＾－＾Ｐｖ?＾?ｍｍ?ｕｓｐｓ??图７．?ＵＳＰ５蛋白质结构预测。ａ．ＵＳＰ５结构域；ｂ．?ＵＳＰ５?Ａｌａ７４１是ＵＣＨ结构域中３－螺旋??束至关重要的氨基酸残基；ｃ．?ＵＳＰ５?Ａｌａ７４１通过疏水作用稳定螺旋束结构，直接与泛素相互??作用。??８－??ｆ￣？?６９７??§?ｒ?口?ＫＡＳＵＭＩ－２??｜?６＿?｜?■?ＢＶ－１７３??ＩＩ?Ｉ?｜?□?ＪＥＫ０－１??Ｉ：?｜｜??＇ｋｌｌｌｎｎＬｎｎｌｒｉｎ?Ｉｎｒｉｎｌｌ??图８．细胞系中ＵＳＰ５及相关基因ＲＴ－ＰＣＲ结果??３６??
【参考文献】：
期刊论文
[1]伴E2A-PBX1融合基因阳性骨髓纤维化一例[J]. 周必琪,王谈真,徐杨,吴德沛. 中华血液学杂志. 2018 (06)
[2]伴TCF3-PBX1阳性的儿童急性淋巴细胞白血病的临床特点及预后[J]. 王毓,张乐萍,陆爱东,左英熹,吴珺. 临床儿科杂志. 2018(01)
[3]Ph样急性淋巴细胞白血病的研究进展[J]. 魏海臣,邱少伟,王建祥. 国际输血及血液学杂志. 2017 (02)
[4]泛素-蛋白酶体途径及意义[J]. 吴慧娟,张志刚. 国际病理科学与临床杂志. 2006(01)
本文编号：3606988
【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图５．?ＷＥＳ检测生物信息学分析流程图??１１）克隆演变??本研究克隆演变模型预测由至上海欧易生物公司协作完成
?０１８??ｉｌｌ?■?＿?－?ｍＳ?＾ｏｌｏ?°〇］ｌ??Ｉ６?－?画?ＭＴＯＲ?Ｊｉ?驗００５??ｏ?１４３?麵?ＭＹＣ?０２８?Ｍｆｒａｍｅｓｈｉｆｔ??ｓ?ｉｔｉ?＿＝?盟ｒ?雜?Ｓｍ＿ｓｅ??〇?２８?６?ｍｍ?ｍｍ?Ｄ＇Ｃｅｒｉ?ｏｏｒ?Ｕｓｐｕｃｉｎｇ??Ｓ?－Ｉ?Ｆｐ°ｔ＾３?§§５?篇?ＳＴ〇Ｐ＿＿ｅＤ??＊ｒｙ（ｊ?ｍｍ?靈－＞Ａ?－＞ＣＴＧＡ〇ＧＴＣ?－＞〇?＞Ｔ??ｆ?｜ｉ＼ｉｉ｜ｉＬｉ?ｉｉｉｉ＾ｉ：ｉｉＥ?：ｓ：：－??图６．?２３例伴ｔ（ｌ；１９）（ｑ２３；ｐｌ３）／Ｅ２Ａ－ＰＢＸｌ融合基因Ｂ－ＡＬＬ患者基因突变图谱??３．３?Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１＋?Ｂ－ＡＬＬ?ＷＥＳ?检测结果分析??本研宄中共有９例患者收集到相对应的ＣＲ期标本，予送检ＷＥＳ测序。在对９??例行ＷＥＳ检测患者标本深入分析后发现，５例患者（５／９，５５．６％）合并有泛素化相??关基因?ＣＤＣ２７?（３／９，３３＿３％）、ＵＳＰ４０?（２／９，２２．２％）、ＵＳＰ５?（２／９，２２．２％）的突变。其??具体突变位点见表９。而２４号病人（Ｐ２４）和３９号病人（Ｐ３９）都存在ＵＳＰ５突变，??且有相同突变位点。针对ＵＳＰ５发生的突变位点进行功能预测发现，ｃ．２２２２Ｃ＞Ａ??（ｐ．Ａｌａ７４ｌＡｓｐ）突变位于多物种的氨基酸保守序列，Ａ７４１是ＵＣＨ结构域中３－螺旋束??至关重要的氨基酸残基，通过疏水作用稳定螺旋束结构，该突变能够改变ＵＣＨ结构??域，导致了?ＵＳＰ５泛素结合能力减弱；而ｃ．２７２ｄｅｌＣ（ｐ．Ｐｒｏ９１Ｈｉｓｆｓ）为框移突变，使ＵＳＰ５??提前出现了终止密码子，从而导致ＵＳＰ５彻底失去功
第二部分?伴ｔ（ｌ：１９）（ｑ２３：ｐｌ３）／Ｅ２Ａ－ＰＢＸｌ融合基因成人急性Ｂ淋巴细胞白血病患者临床与分子遗传学特征研究??在Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因致白血病过程中的作用，本研究选取了人源Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合??基因阳性的Ｂ－ＡＬＬ细胞株６９７、ＫＡＳＵＭＩ，检测其ＵＳＰ５、Ｐ５３、Ｍｄｍ２、Ｐ２１以及??Ｂａｘ的表达，并选取ＢＶ－１７３、ＪＥＫ０－１两株人源Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因阴性的Ｂ－ＡＬＬ??细胞株作为对照。可见在Ｅ２Ａ－ＰＢＸ１融合基因阳性细胞株中，ＵＳＰ５ｍＲＮＡ表达量降??低，而Ｐ５３和Ｐ２１ｍＲＮＡ表达量也降低（图８）。??ｕｂｉｑｕｍ＾－＾Ｐｖ?＾?ｍｍ?ｕｓｐｓ??图７．?ＵＳＰ５蛋白质结构预测。ａ．ＵＳＰ５结构域；ｂ．?ＵＳＰ５?Ａｌａ７４１是ＵＣＨ结构域中３－螺旋??束至关重要的氨基酸残基；ｃ．?ＵＳＰ５?Ａｌａ７４１通过疏水作用稳定螺旋束结构，直接与泛素相互??作用。??８－??ｆ￣？?６９７??§?ｒ?口?ＫＡＳＵＭＩ－２??｜?６＿?｜?■?ＢＶ－１７３??ＩＩ?Ｉ?｜?□?ＪＥＫ０－１??Ｉ：?｜｜??＇ｋｌｌｌｎｎＬｎｎｌｒｉｎ?Ｉｎｒｉｎｌｌ??图８．细胞系中ＵＳＰ５及相关基因ＲＴ－ＰＣＲ结果??３６??
【参考文献】：
期刊论文
[1]伴E2A-PBX1融合基因阳性骨髓纤维化一例[J]. 周必琪,王谈真,徐杨,吴德沛. 中华血液学杂志. 2018 (06)
[2]伴TCF3-PBX1阳性的儿童急性淋巴细胞白血病的临床特点及预后[J]. 王毓,张乐萍,陆爱东,左英熹,吴珺. 临床儿科杂志. 2018(01)
[3]Ph样急性淋巴细胞白血病的研究进展[J]. 魏海臣,邱少伟,王建祥. 国际输血及血液学杂志. 2017 (02)
[4]泛素-蛋白酶体途径及意义[J]. 吴慧娟,张志刚. 国际病理科学与临床杂志. 2006(01)
本文编号：3606988
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