扩增子测序技术检测石蜡包埋组织标本耐药结核基因的研究

发布时间：2022-01-24 22:47

　　目的 用基于多重PCR（multiplex PCR,mPCR）扩增子的二代测序（next-generation sequencing,NGS）技术（mPCR-NGS）检测MTB的耐药基因突变,并评估其检测石蜡包埋组织标本诊断耐药结核病的临床应用价值。方法 选取北京市昌平区结核病防治所2013年4月至2015年10月常规进行了利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星和氧氟沙星比例法检测且具有药敏试验结果的50株MTB临床分离株,包括42株耐药MTB和8株敏感MTB菌株。参考耐药基因数据库及相关文献,针对以上8种抗结核药物主要耐药基因及常见位点设计耐药基因组合,建立有效的检测方案。收集首都医科大学附属北京胸科医院病理科2017年11月至2018年9月耐药结核病患者55例的石蜡包埋组织标本,探针熔解曲线法检测结果为利福平、异烟肼、乙胺丁醇和氟喹诺酮类至少存在一种耐药相关基因突变。首先对已知表型药敏试验结果的MTB临床分离株进行mPCR-NGS检测,验证该方法检测纯菌样本的有效性,再进一步检测结核病患者石蜡包埋组织标本进行临床验证。主要评价指标为敏感度和特异度以及一致性。... 

【文章来源】：中华结核和呼吸杂志. 2020,43(03)

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【参考文献】：
期刊论文
[1]荧光PCR探针熔解曲线法检测结核分枝杆菌复合群对利福平和异烟肼耐药性的价值[J]. 吴慧娜,孙付胜,刘清文,戎中录,张纪东,高阳,李永福,常斐.  中国防痨杂志. 2019 (01)
[2]Comparison of Histological, Microbiological, and Molecular Methods in Diagnosis of Patients with TBLN Having Different Anti-TB Treatment Background[J]. CHE Nan Ying,HUANG Shao Jun,MA Yan,HAN Yi,LIU Zi Chen,ZHANG Chen,MU Jing,ZHAO Dan,QU Yang,ZHANG Hai Qing,LIU Zhi Dong,XU Shao Fa.  Biomedical and Environmental Sciences. 2017(06)
[3]中国结核病病理学诊断专家共识[J].   中华结核和呼吸杂志. 2017 (06)
[4]二代测序技术在结核分枝杆菌研究中的应用进展[J]. 徐鹏,甘明宇,高谦.  微生物与感染. 2015(01)
[5]比例法测试结核分支杆菌药物敏感性的探讨[J]. 刘宇红,王甦民,那希宽.  中华结核和呼吸杂志. 2000(02)



本文编号：3607435