自噬基因FKBP1A在头颈部鳞癌中的表达及其作用

发布时间：2022-01-25 06:19

　　目的研究头颈部鳞癌（HNSCC）的自噬基因调控及生物标志物FK506结合蛋白1A（FKBP1A）在HNSCC中的表达及影响。方法利用肿瘤基因组图谱（TCGA）分析HNSCC组织与正常黏膜组织的基因表达差异;利用DAVID生物信息学资源库进行HNSCC中差异明显的自噬相关基因功能注释与富集的研究,利用单因素与多因素COX回归分析寻找对于TCGA中HNSCC患者预后有意义的基因;利用基因表达综合数据库（GEO）验证目的基因与HNSCC患者的预后,利用Kaplan-Meier Plotter分析自噬相关基因与HNSCC患者预后相关性;利用免疫组化实验及实时荧光定量PCR检测对比临床HNSCC组织样本与癌旁样本中FKBP1A的表达量。结果相比于正常组织,HNSCC组织共有38个自噬相关基因（其中28个上调,10个下调）发生显著的变化。这些差异基因主要参与人体中生物过程（BP）,细胞成分（CC）和分子功能（MF）部分中的自噬相关通路。单因素与多因素Cox回归分析发现有18个自噬相关基因在TCGA数据库中与HNSCC患者的预后相关。将其中的高风险基因在GEO数据库中进行验证,发现FKBP1A与HN... 

【文章来源】：中国医师杂志. 2020,22(08)

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本文编号：3608041