基于数据挖掘分析LUM基因在胃癌中的表达及意义

发布时间：2022-01-25 09:25

　　目的:通过数据库分析LUM基因在胃癌中的表达情况及意义。方法:通过Oncomine数据库分析LUM基因在胃癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析LUM基因表达与胃癌患者生存周期的关系;同时利用MethHC数据库分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA数据集的UALCAN在线数据库对LUM在胃癌患者中的表达及预后进行验证;并通过String数据库分析LUM基因的蛋白相互作用及上下游调控关系。结果:胃癌组织中LUM的mRNA表达较正常对照组明显增高;Meta分析进一步证实LUM基因的表达在胃癌组织中明显增高。GEPIA分析发现高表达组患者生存周期明显短于低表达组（P<0.05）。与此同时,甲基化分析中得出LUM基因甲基化水平肿瘤组明显高于正常组;TCGA数据集验证显示LUM在胃癌组织中的表达量与预后有关;蛋白质网络分析得出,LUM可能与OGN、CHST1、CHST5、CHST6、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A2、ACAN等蛋白相互作用。结论:基于多个数据库的数据挖掘发现,LUM基因在胃癌组织中呈现高表达,且其表达水平与胃癌患者总体生存相关;LUM是与... 

【文章来源】：肿瘤预防与治疗. 2020,33(07)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

Oncomine数据库中在胃癌中的基因差异性表达

Oncomine数据库中LUM在不同胃癌组织芯片中的表达结果显示,共有5项符合条件的研究并且每项研究中胃癌组织中LUM基因表达均高于正常对照组织(图3)。进一步对这5项研究进行荟萃分析发现,在胃癌组织中LUM表达明显高于正常对照组织(P<0.001)(图4)。图3 Oncomine数据库中LUM在不同胃癌中的表达

Oncomine数据库中LUM在不同胃癌中的表达

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3608291