花椒窄吉丁触角转录组及嗅觉相关基因分析

发布时间：2022-02-11 18:47

　　【目的】建立花椒窄吉丁Agrilus zanthoxylumi成虫触角转录组数据库,挖掘嗅觉相关基因,为今后研究其触角的化学感受机制及生物防控提供理论支撑。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq 6000对花椒窄吉丁雌雄成虫触角进行转录组测序,用Trinity软件对获得的高质量reads进行序列拼接与组装;使用BLAST软件将触角转录组数据比对NR, NT, Swiss-Prot, GO, KEGG, BLASTX, eggNOG, Pfam, TmHMM, SignalP, KO, Map, BLASTP和RNAMMER公共数据库;基于初步筛选到的花椒窄吉丁候选气味结合蛋白（odorant binding protein, OBP）和化学感受蛋白（chemosensory protein, CSP）以及其他鞘翅目昆虫的同源蛋白的核苷酸序列,利用MEGA软件进行系统进化分析。运用RPKM （reads per kilobase per million mapped reads）值对嗅觉相关基因表达量进行分析。【结果】花椒窄吉丁雌雄成虫触角转录组测序共获得36 209... 

【文章来源】：昆虫学报. 2020,63(10)北大核心CSCD

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【部分图文】：

花椒窄吉丁雌雄成虫触角转录组unigenes长度分布

表2 花椒窄吉丁雌雄成虫触角转录组基因功能注释结果统计Table 2 Statistics of gene function annotation in theantennal transcriptome of female and male adults ofAgrilus zanthoxylumi 数据库Database Unigene数量Number of unigenes 占比(%)Proportion NR 15 070 41.62 NT 3 692 10.19 Swiss-Prot 12 508 34.54 GO 11 614 32.08 BLASTX 11 676 32.25 eggNOG 8 766 24.21 Pfam 9 428 26.04 TmHMM 2 500 6.90 SignalP 1 301 3.59 KO 6 550 18.09 Map 4 025 11.12 BLASTP 9 458 26.12 RNAMMER 14 0.04图3 NR数据库中注释的花椒窄吉丁雌雄成虫触角unigenes的物种分布

NR数据库中注释的花椒窄吉丁雌雄成虫触角unigenes的物种分布

【参考文献】：
期刊论文
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[3]悬铃木方翅网蝽触角转录组及嗅觉相关基因分析[J]. 杨海博,胡镇杰,李定旭,朱品红,董钧锋.  农业生物技术学报. 2018(12)
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[6]渭南市花椒窄吉丁虫危害风险分析[J]. 党国刚,郭军成,孙杜闯,庄丽娟.  防护林科技. 2017(04)
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[10]春季防治花椒窄吉丁虫[J]. 李辉.  农药市场信息. 2013 (12)



本文编号：3620774