半滑舌鳎des基因的表达及其启动子功能分析

发布时间：2022-02-20 02:34

　　利用NCBI上已经发表的半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）基因组及转录组序列,发现了半滑舌鳎两个有结蛋白（Desmin）基因（des和des-like）,且des-like具有两个剪切型des-like_X1、des-like_X2。系统进化树及基因结构分析发现,半滑舌鳎的des基因和des-like基因分别与硬骨鱼的des基因和des-like基因聚为一支,物种间des和des-like氨基酸序列相似性分别在90%和85%以上。保守性与染色体共线性分析发现,半滑舌鳎的des基因和哺乳动物的des基因具有相同的起源,而其des-like基因是通过硬骨鱼的第三次全基因组复制获得的。qRT-PCR的检测分析发现,des基因在肠和心脏中表达量较高,在肌肉中只是痕量表达;而des-like基因则在心脏和肌肉中表达最高,在肠中痕量表达,说明des与des-like已经出现了功能的分化而且可能存在功能上的互补效应。有趣的是,des-like_X1只在心脏中表达,本研究推测des-like_X1对于... 

【文章来源】：中国海洋大学学报(自然科学版). 2020,50(S1)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 半滑舌鳎des及des-like基因ORF的序列验证
    1.3 半滑舌鳎des及des-like序列的生物信息学分析
    1.4 半滑舌鳎des及des-like基因在各组织及胚胎中的表达量分析
    1.5 启动子分析
2 结果
    2.1 des、des-like基因结构及系统进化分析
    2.2 半滑舌鳎des、des-like基因的保守性及染色体共线性分析
    2.3 半滑舌鳎des、des-like基因在各组织及胚胎的表达分析
    2.4 半滑舌鳎des基因的启动子活性分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]结蛋白对非洲爪蛙胚胎早期发育的影响[J]. 袁芳,刘佳,李卉,袁栎.  南京医科大学学报(自然科学版). 2015(04)
[2]牛结蛋白基因启动子的克隆及功能的初步分析[J]. 杜巍,李树峰,佟慧丽,杨翠翠,刘丹,严云勤.  畜牧兽医学报. 2014(01)
[3]小鼠骨骼肌Desmin启动子的克隆及表达活性分析[J]. 薛超,安星兰,王春生,朴善花,苗向阳,安铁洙.  黑龙江畜牧兽医. 2011(07)
[4]肝再生过程中肾desmin和GFAP的表达以及MMPs的变化[J]. 张新胜,程秋妍,杜娟,王雁北,徐存拴.  河南师范大学学报(自然科学版). 2009(05)
[5]半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis Günther）工厂化养殖技术的初步研究[J]. 黄大宏,余海,孙建璋.  现代渔业信息. 2007(08)



本文编号：3634133