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基因芯片筛选脂蛋白脂酶基因杂合敲除小鼠的差异表达基因和通路

发布时间:2022-07-12 15:33
  目的·筛选脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,Lpl)基因杂合敲除(Lpl+/-)小鼠和野生型(wild type,WT)小鼠的胰岛组织中差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和通路,探讨脂毒性介导2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)发病过程中的分子机制。方法·将Lpl+/-小鼠和WT小鼠的胰岛进行分离纯化。通过基因芯片分析获得DEGs,并对其进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)对关键基因表达进行验证。结果·共筛选出187个DEGs。GO功能分析和KEGG通路分析显示,DEGs主要富集于免疫细胞增殖分化、炎症信号通路及细胞黏附等生物过程。在Lpl+/-小鼠和WT小鼠的表达差异最为显著的前10个基因中,gremlin 1(Grem... 

【文章页数】:8 页

【文章目录】:
1 对象和方法
    1.1 实验动物及主要试剂
    1.2 研究方法
        1.2.1 胰岛的分离及纯化
        1.2.2 微阵列芯片杂交与数据分析
        1.2.3 RNA抽提及实时荧光定量PCR检测
    1.3 统计学方法
2 结果
    2.1 筛选DEGs
    2.2 GO功能分析
    2.3 KEGG通路分析
    2.4 关键基因的表达验证
3 讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]脂蛋白脂酶基因敲除小鼠糖脂代谢研究及其胰岛素抵抗的机制探索[J]. 李阳雪,郑爽,韩亭亭,章瑶,姜冬冬,胡耀敏.  中华内分泌代谢杂志. 2015 (02)
[2]脂蛋白脂酶基因敲除小鼠糖脂代谢及胰岛素敏感性研究[J]. 金晶,胡耀敏,李圣贤,刘伟.  中华内分泌代谢杂志. 2011 (05)



本文编号:3659384

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