毛竹PP2C基因家族鉴定与表达分析

发布时间：2022-07-12 17:06

　　PP2C （2C type protein phosphatase）是一类广泛存在于生物体中、具有重要调控作用的蛋白磷酸酶,在植物抵抗逆境胁迫及激素响应等过程中具有重要作用,而在毛竹（Phyllostachys edulis）中的研究尚未充分开展。本研究以毛竹为材料,利用生物信息学方法,从毛竹全基因组中鉴定出125个具有完整PP2C保守结构域的基因,这些基因编码蛋白长度为110～1 086 aa,分子量为12.07～121.02 kD;系统进化分析表明,125个毛竹PP2C基因共可分为9个亚家族,其中4个基因（PH02Gene36278.t1, PH02Gene48541.t1,PH02Gene37946.t1, PH02Gene29918.t1）未被分入任何亚家族,而是单独形成分枝;基于转录组数据的组织特异性分析显示,121个PP2C基因在毛竹不同组织及不同发育阶段中都有不同程度的表达,多数PP2C基因在毛竹笋的不同发育阶段呈现较高的表达,也有部分PP2C基因在根与叶片等部位具有较高的表达;qRT-PCR结果显示,毛竹经过脱落酸处理后有9个PP2C基因上调表达、1个下调表达;在盐和茉... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 毛竹PP2C基因家族鉴定
    1.3 毛竹PP2C基因结构与进化分析
    1.4 毛竹PP2C基因的组织特异性分析
    1.5 非生物胁迫及激素处理条件下毛竹PP2C基因表达分析
2 结果与分析
    2.1 毛竹PP2C基因家族鉴定与理化性质分析
    2.2 毛竹PP2C家族基因结构与蛋白保守结构域分析
    2.3 毛竹PP2C基因家族系统进化分析
    2.4 毛竹PP2C家族基因组织特异性分析
    2.5 毛竹PP2C家族基因在盐胁迫与不同激素处理下的表达模式分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]毛竹PeNAC047基因的克隆与表达分析[J]. 赵钟毓,侯丹,胡秋涛,魏涵天,郑颖,林新春.  农业生物技术学报. 2020(01)
[2]毛竹bHLH转录因子的鉴定及其在干旱和盐胁迫条件下的表达分析[J]. 徐秀荣,杨克彬,王思宁,高志民.  植物科学学报. 2019(05)
[3]毛竹B3家族全基因组鉴定及表达模式分析[J]. 吴佳军,俞率成,刘志刚,傅鹰,周明兵.  农业生物技术学报. 2019(01)
[4]毛竹PIN基因家族的鉴定与生物信息学分析[J]. 白羽聪,李翔宇,程占超,侯丹,刘俊,谢丽华,高健.  分子植物育种. 2019(16)
[5]拟南芥蛋白磷酸酶PP2C31的盐胁迫响应功能研究[J]. 张弛,蔚静玲,储谟立,张邦民,兰文智.  中国科技论文. 2018(18)
[6]葡萄PP2C家族基因的鉴定与表达分析[J]. 何红红,路志浩,马宗桓,梁国平,马丽娟,万鹏,毛娟.  园艺学报. 2018(07)
[7]竹类植物快速生长的机理研究进展[J]. 陶贵耘,傅鹰,周明兵.  农业生物技术学报. 2018(05)
[8]毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达[J]. 程占超,侯丹,马艳军,高健.  浙江农林大学学报. 2017(04)
[9]毛竹NAC转录因子家族生物信息学分析[J]. 黎帮勇,胡尚连,曹颖,徐刚.  基因组学与应用生物学. 2015(08)
[10]浙江安吉县毛竹林高温干旱灾害调研报告[J]. 柳丽娜,董敦义,李云,李雪涛.  世界竹藤通讯. 2014(01)

硕士论文
[1]玉米脱落酸受体（PYL3）与2C型丝氨/苏氨酸蛋白磷酸酶（PP2C）的互作分析[D]. 程梅.四川农业大学 2014



本文编号：3659516