EGFR、KRAS驱动基因突变肺腺癌二级转录组数据库的构建

发布时间：2022-07-29 14:32

　　目的:本研究拟通过分析EGFR、KRAS突变肺腺癌特有及共有的转录调控网络,筛选EGFR、KRAS突变肺腺癌特有及共有关键分子标志物。探讨临床EGFR、KRAS突变肺腺癌转移、复发、耐药及预后不良机制,为EGFR、KRAS突变肺腺癌现有临床方案的优化提供理论依据。方法:首先,以来自GEO和TCGA数据集的EGFR、KRAS突变肺腺癌的基因芯片及高通量测序原始数据为研究对象,按照拟定标准处理建立二级数据库。而后,应用差异表达分析、功能富集分析、网络分析等方法分别建立EGFR、KRAS突变肺腺癌转录调控网络,分析转移、复发、耐药相关基因,应用生存分析法筛选预后相关基因。随后,应用关联分析法建立EGFR、KRAS突变肺腺癌共有转录调控网络,分析两者转录水平的共有关系及相互作用,筛选共有关键基因。结果:本研究建立了1个EGFR、KRAS突变肺腺癌转录组数据库,包括对应生存数据库9个,其中基因芯片数据库3个,转录组数据库6个,共纳入肺癌患者1542例。构建并分析EGFR突变肺腺癌转录调控图谱及mRNA子网络,发现关键基因共492个,其中mRNA 323个、lncRNA 156个、miRNA 13... 

【文章页数】：101 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
英文摘要
1 引言
    1.1 问题的提出与研究意义
    1.2 国内外相关研究综述
    1.3 研究方法
    1.4 数据来源与处理
    1.5 论文框架
    1.6 论文的创新点
2 EGFR、KRAS突变肺腺癌组学二级数据库的构建
    2.1 对象与方法
    2.2 结果
    2.3 小结
3 EGFR突变相关肺腺癌转录调控图谱的构建
    3.1 筛选差异表达基因
    3.2 EGFR突变肺腺癌转录调控图谱构建
    3.3 图谱内关键基因的功能富集分析
    3.4 图谱内关键基因的生存分析
    3.5 小结
4 KRAS突变相关肺腺癌转录调控图谱的构建
    4.1 筛选差异表达基因
    4.2 KRAS突变肺腺癌转录调控图谱构建
    4.3 关键基因的功能富集分析
    4.4 图谱内关键基因的生存分析
    4.5 小结
5 EGFR、KRAS突变肺腺癌组学关联分析及共有转录调控图谱的构建
    5.1 EGFR、KRAS突变肺腺癌关联分析
    5.2 EGFR、KRAS突变肺腺癌共有转录调控图谱构建
    5.3 小结
6 结结论与讨论
    6.1 结论
    6.2 建议
    6.3 不足与展望
参考文献
致谢
在学期间承担/参与的科研课题与研究成果
个人简历


【参考文献】：
期刊论文
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[10]含胸腺肽免疫增强的自体CIK细胞联合IL-2方案治疗高龄弥漫大B细胞淋巴瘤[J]. 杨洋,杨波,脱帅,卢学春,朱宏丽,脱朝伟,蔡力力,迟小华,于睿莉,陈云燕,张文英,刘洋,王瑶,代汉仁,韩为东,张峰,姚善谦.  军医进修学院学报. 2012(05)



本文编号：3666637