光周期途径成花关键基因GIGANTEA和CONSTANS的进化机制
发布时间：2022-10-18 18:00
GI和CO在植物光周期开花诱导途径中起促进作用。GI是生物节理钟输出的重要基因,正调控CO基因的表达。CO基因可以对光信号和生物钟信号进行整合,并激活下游基因FT的表达,诱导植物开花。因此,本研究通过生物信息学手段从14个基因组中鉴定所有的GI、CO基因拷贝。从外显子-内含子结构、结构域和基序分析、基因重复以及差异表达分析等方面开展系统发育分析研究,探讨GI和CO基因家族在植物中的潜在功能。1、对14个基因组已测序的物种（长日照植物、短日照植物和日中性植物各3种,藻类植物、苔藓植物、蕨类植物和裸子植物各1种,以及原始的被子植物无油樟）GI和CO基因家族进行鉴定,GI和CO家族成员分别为20和159个。2、系统发育分析显示,14个植物基因组的20个GI基因划分为单子叶和双子叶两个进化枝。159个CO基因根据其结构域聚类情况,可以被分成B1-B3进化枝,各自代表一个原始的基因谱系。3、20个GI基因的209在内含子中,有145个是相位0,而相位1和相位2仅有31,32。形成大量的对称外显子。而在CO基因B1-B3亚家族中,大多数基因大都存在着2-4个外显子,尤其在B2亚家族中显示在每个CO...
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 模式植物拟南芥
1.3 植物开花调控途径
1.3.1 光周期途径
1.3.2 其他开花调控途径
1.3.2.1 春化途径
1.3.2.2 自主途径
1.3.2.3 赤霉素途径
1.3.2.4 温敏途径
1.3.3 成花诱导因子整合
1.3.4 开花抑制基因
1.4 GI基因的研究进展
1.4.1 GI的结构
1.4.2 GI的功能
1.5 CO基因的研究进展
1.5.1 CO的结构
1.5.2 CO的功能
1.6 实验的目的和意义
第二章 GI基因家族的分子进化
2.1 材料与方法
2.1.1 数据的收集及本地数据库的构建
2.1.2 多序列比对和系统发育分析
2.1.3 GI转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析
2.1.4 染色体定位及一级结构和理化性质的分析
2.1.5 串联重复和同线性分析
2.1.6 GI转录因子家族基因的表达分析
2.2 结果与分析
2.2.1 GI转录因子基因家族成员的鉴定
2.2.2 GI转录因子基因家族分子进化分析
2.2.3 GI的结构分析
2.2.3.1 GI蛋白的一级结构和理化性质分析
2.2.3.2 GI家族成员蛋白磷酸化位点分析
2.2.3.3 内含子和外显子的分布
2.2.3.4 结构域和基序分析
2.2.4 GI基因家族共线性分析和基因复制事件
2.2.5 GI家族基因的表达和功能分化
2.3 讨论
2.4 小结
第三章 CO基因家族的分子进化
3.1 材料和方法
3.1.1 数据的收集及本地数据库的构建
3.1.2 多序列比对和系统发育分析
3.1.3 CO转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析
3.1.4 染色体定位及一级结构和理化性质的分析
3.1.5 串联重复和同线性分析
3.1.6 CO转录因子家族基因的表达分析
3.2 结果和讨论
3.2.1 CO转录因子基因家族成员的鉴定
3.2.2 CO转录因子基因家族分子进化分析
3.2.3 CO家族基因的结构分析
3.2.3.1 CO蛋白的一级结构和理化性质分析
3.2.3.2 CO家族成员蛋白磷酸化位点分析
3.2.3.3 内含子和外显子的分布
3.2.3.4 结构域和基序分析
3.2.4 CO基因家族共线性分析和基因复制事件
3.2.5 CO家族基因的表达和功能分化
3.3 讨论
3.4 小结
参考文献
个人简介
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]高等植物开花诱导研究进展[J]. 孙昌辉,邓晓建,方军,储成才. 遗传. 2007(10)
[2]控制拟南芥和水稻开花时间光周期途径的分子机制[J]. 彭凌涛. 植物生理学通讯. 2006(06)
博士论文
[1]豆科和禾本科植物热激转录因子基因家族的分子进化研究[D]. 林勇翔.安徽农业大学 2013
本文编号：3692789
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 模式植物拟南芥
1.3 植物开花调控途径
1.3.1 光周期途径
1.3.2 其他开花调控途径
1.3.2.1 春化途径
1.3.2.2 自主途径
1.3.2.3 赤霉素途径
1.3.2.4 温敏途径
1.3.3 成花诱导因子整合
1.3.4 开花抑制基因
1.4 GI基因的研究进展
1.4.1 GI的结构
1.4.2 GI的功能
1.5 CO基因的研究进展
1.5.1 CO的结构
1.5.2 CO的功能
1.6 实验的目的和意义
第二章 GI基因家族的分子进化
2.1 材料与方法
2.1.1 数据的收集及本地数据库的构建
2.1.2 多序列比对和系统发育分析
2.1.3 GI转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析
2.1.4 染色体定位及一级结构和理化性质的分析
2.1.5 串联重复和同线性分析
2.1.6 GI转录因子家族基因的表达分析
2.2 结果与分析
2.2.1 GI转录因子基因家族成员的鉴定
2.2.2 GI转录因子基因家族分子进化分析
2.2.3 GI的结构分析
2.2.3.1 GI蛋白的一级结构和理化性质分析
2.2.3.2 GI家族成员蛋白磷酸化位点分析
2.2.3.3 内含子和外显子的分布
2.2.3.4 结构域和基序分析
2.2.4 GI基因家族共线性分析和基因复制事件
2.2.5 GI家族基因的表达和功能分化
2.3 讨论
2.4 小结
第三章 CO基因家族的分子进化
3.1 材料和方法
3.1.1 数据的收集及本地数据库的构建
3.1.2 多序列比对和系统发育分析
3.1.3 CO转录因子家族基因和蛋白质结构及基序分析
3.1.4 染色体定位及一级结构和理化性质的分析
3.1.5 串联重复和同线性分析
3.1.6 CO转录因子家族基因的表达分析
3.2 结果和讨论
3.2.1 CO转录因子基因家族成员的鉴定
3.2.2 CO转录因子基因家族分子进化分析
3.2.3 CO家族基因的结构分析
3.2.3.1 CO蛋白的一级结构和理化性质分析
3.2.3.2 CO家族成员蛋白磷酸化位点分析
3.2.3.3 内含子和外显子的分布
3.2.3.4 结构域和基序分析
3.2.4 CO基因家族共线性分析和基因复制事件
3.2.5 CO家族基因的表达和功能分化
3.3 讨论
3.4 小结
参考文献
个人简介
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]高等植物开花诱导研究进展[J]. 孙昌辉,邓晓建,方军,储成才. 遗传. 2007(10)
[2]控制拟南芥和水稻开花时间光周期途径的分子机制[J]. 彭凌涛. 植物生理学通讯. 2006(06)
博士论文
[1]豆科和禾本科植物热激转录因子基因家族的分子进化研究[D]. 林勇翔.安徽农业大学 2013
本文编号：3692789
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3692789.html
最近更新
教材专著
