全外显子组测序技术鉴定1个Olmsted综合征家系的致病基因和4个表皮松解性掌跖角化症家系的KRT9基因突变谱分析及产前

发布时间：2022-10-19 14:18

　　背景:（1）Olmsted 综合征（Olmsted syndrome OMIM:#614594）是一种罕见的以残毁性掌趾角化和腔口周围角化斑两个特征性皮损为主要临床特征的先天性皮肤病。其他临床表现还包括弥漫性脱发、甲营养不良、口腔黏膜白斑、指跖的缩窄等。已发现的Olmsted综合征致病基因包括TRPV3、MBTPS2等。（2）表皮松解性掌跖角化症（epidermolyticpalmoplantarkeratoderma,EPPKOMIM:#144200）为一种较为常见的常染色体显性遗传性皮肤病,临床表现为掌跖皮肤呈弥漫性的角质增厚,主要由KRT9、KRT1等基因的突变造成。目的:（1）用全外显子组测序技术（whole exome sequencing,WES）寻找一个疑似Olmsted综合征家系的致病基因突变,为家系的临床确诊和可能的发病分子机制提供资料,并为该家系的后续产前DNA诊断、植入前遗传学诊断（preimplantation genetic diagnosis,PGD）等奠定基础。（2）绘制 4 个 EPPK 家系的致病基因突变谱。在明确致病基因突变后,应其中3个家系的请求,... 

【文章页数】：89 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
致谢
摘要
ABSTRACT
英文缩略词
第一部分 全外显子组测序技术鉴定1个Olmsted综合征家系的致病基因
    1 引言
        1.1 Olmsted综合征及其分子遗传学研究
            1.1.1 Olmsted综合征的临床特征
            1.1.2 Olmsted综合征的分子遗传学
            1.1.3 Olmsted综合征与其他PPK的鉴别诊断
        1.2 全外显子组测序技术
            1.2.1 全外显子组测序技术简介
            1.2.2 全外显子组测序技术的优势及挑战
            1.2.3 全外显子组测序技术在孟德尔病中的应用
    2 实验材料与方法
        2.1 主要溶液和试剂
        2.2 主要仪器
        2.3 相关搜索网站及软件
        2.4 实验方法
            2.4.1 Olmsted综合征家系的收集
            2.4.2 基因组DNA的提取和纯化
            2.4.3 PCR扩增KRT9和KRT1基因的编码区
            2.4.4 Sanger DNA测序
            2.4.5 全外显子组测序
            2.4.6 全外显子组测序数据的生物信息学分析
            2.4.7 基因变异体的Sanger DNA测序验证
    3 实验结果
        3.1 EPPK相关致病基因突变的排除
        3.2 全外显子组测序寻找致病基因的结果
            3.2.1 WES的质量
            3.2.2 WES所发现的突变
        3.3 KRT10及TRPV3基因突变的验证
    4 讨论
    5 结论
    参考文献
第二部分 4个EPPK家系的KRT9基因突变谱分析及产前DNA诊断
    1 掌跖角化症概述
        1.1 掌跖角化症和表皮松解性掌跖角化症(EPPK)
        1.2 角蛋白
        1.3 EPPK的致病基因
        1.4 产前DNA诊断在EPPK中的应用
    2 实验材料与方法
        2.1 EPPK家系的收集
        2.2 基因组DNA的纯化及PCR扩增KRT9基因编码区
        2.3 正、反向Sanger DNA测序
        2.4 AS-PCR验证KRT9基因突变
        2.5 基于已知DNA致病突变的EPPK高风险胎儿的产前DNA诊断
    3 实验结果
        3.1 正、反向Sanger测序的结果
        3.2 AS-PCR验证KRT9基因突变的结果
        3.3 胎儿产前DNA诊断正、反向Sanger测序的结果
    4 讨论
    5 结论
    参考文献
综述
    参考文献
个人简介及硕士学习期间发表的论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]Olmsted综合征一例及文献复习[J]. 常静,韦祝,梁晓婷.  医学临床研究. 2016 (04)
[2]Olmsted综合征1例（附文献复习）[J]. 常树霞,王晓华,顾有守.  皮肤性病诊疗学杂志. 2011(05)
[3]母女同患Olmsted综合征[J]. 陈龙,贺美林,覃莉,孔庆云.  中华皮肤科杂志. 2011 (09)
[4]Olmsted综合征一例[J]. 王鹏,李君枣,王媚媚.  中华皮肤科杂志. 2009 (08)
[5]Olmsted综合征与1例文献复习[J]. 陆原,陈达灿,翁翊,李清,禤国维.  中国皮肤性病学杂志. 2008(07)
[6]Olmsted综合征1例及文献复习[J]. 黄长征,余念文,吴艳,张晶,杨凌云,陶娟,田进,李延,刘业强,李家文,王椿森,涂亚庭.  中国麻风皮肤病杂志. 2007(09)
[7]Olmsted综合征1例[J]. 庞晓文,耿丽红.  临床皮肤科杂志. 2007(01)
[8]Olmsted综合征国内首报[J]. 马东来,胡瑾,方凯.  临床皮肤科杂志. 2006(10)
[9]Olmsted综合征:报道1例罕见病例[J]. Al-Mutairi N.,Sharma A.K.,Nour-Eldin O.,Al-Adawy E.,刘艳.  世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册). 2006(02)
[10]Olmsted综合征2例[J]. 钟珊,王兵,杨勇,冯华,陈喜雪.  中国麻风皮肤病杂志. 2009 (02)



本文编号：3693520