2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群HIV基因亚型分布及耐药性研究

发布时间：2022-12-08 00:46

　　[目的]了解云南省德宏州陇川县2017年新报告人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（Human Immunodeficiency Virus 1 Type,HIV-1）阳性人群HIV基因亚型分布,明确该地区HIV-1毒株的分子流行特征;了解2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群基因亚型流行重组与变异情况,分析病毒的跨境传播、病毒的变化;了解2017年陇川县新报告HIV-1未接受抗病毒治疗人群原发耐药的流行状况,探索HIV-1流行亚型与耐药发生和流行的关系,为今后该地HIV的跨境传播防控和抗病毒治疗方案的制定提供科学依据。[方法]本次研究采用横断面调查方法,对2017年陇川县新报告HIV-1阳性人群特征进行流行病学分析。通过采集血样,分离血浆后提取核酸,使用RT-PCR和Nested-PCR扩增HIV-1 5’ LRT-pol基因序列片段,扩增产物送至擎科公司测序,测序结果使用Lasergene软件包中的SeqMan应用程序对序列进行拼接和处理;从美国Los Alamos实验室HIV核酸数据库下载亚型参考序列与扩增获得的序列合并后,使用在线工具进行比对,运用MEGA软件采用最大似然比法构建进化树;对可... 

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【学位级别】：硕士

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缩略词表
中文摘要
ABSTRACT
前言
    1.研究背景
        1.1 HIV-1感染现状
        1.2 HIV-1基因亚型流行特征
        1.3 HIV-1耐药研究现状
    2.研究的目的和意义
        2.1 研究目的
        2.2 研究意义
材料与方法
    1.研究对象
        1.1 对象来源
        1.2 对象纳入标准
    2.研究内容
    3.实验设备与试剂
        3.1 实验设备
        3.2 实验试剂
    4.分析工具
    5.伦理学原则
    6.研究方法
        6.1 技术路线
        6.2 流行病学调查
        6.3 样本初步处理和保存
        6.4 HIV-1 5' LRT-pol基因片段扩增与测序
        6.5 基因序列数据整理与分析
        6.6 统计分析
    7.质量控制
        7.1 现场调查采样阶段
        7.2 实验阶段
结果
    1.人口统计学基本信息
    2.HIV-1基因片段扩增测序结果
    3.HIV-1系统进化分析结果
    4.HIV-1流行重组毒株重组分析
    5.HIV-1基因亚型分布
    6.中国籍与缅甸籍HIV-1阳性人群基因亚型差异
    7.HIV-1独特重组型毒株重组分析
    8.HIV-1基因亚型人口学特征Logistic回归分析
    9.基因型耐药突变与发生
        9.1 基因型耐药在人群中的分布
        9.2 基因型耐药情况
        9.3 HIV-1基因型与耐药发生情况
        9.4 RP区和RT区耐药突变位点与亚型的关系
讨论
    1.陇川县HIV-1阳性人群流行病学特征
    2.系统进化和重组分析情况
    3.核酸阳性者基因型分布特征
    4.缅甸籍与中国籍核酸阳性者基因亚型分布特征
    5.HIV-1基因亚型分布影响因素
    6.基因耐药突变与耐药发生
    7.HIV-1基因亚型与耐药发生
结论
建议
研究创新点与局限性
    1.研究创新点
    2.研究局限性
参考文献
附录1 陇川县HIV-1毒株图谱
综述
    鲜文献
攻读学位期间获得的学术成果
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]云南省2个边境地区新报告艾滋病病毒感染者HIV-1基因亚型分析[J]. 韦焘,杨朝军,陈敏,贾曼红,马艳玲,罗红兵,陆林.  中华流行病学杂志. 2018 (12)
[2]2016年云南省德宏傣族景颇族自治州新报告HIV感染者原发性耐药研究[J]. 杨锦,陈晓晨,段星,王继宝,王译葵,杨涛,叶润华,杨跃诚,姚仕堂,段松,何纳.  中华预防医学杂志. 2018 (12)
[3]2018年8月全国艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;.  中国艾滋病性病. 2018(10)
[4]广州市2015年男男性行为者HIV-1感染者亚型和耐药研究[J]. 吴昊,张亚丽,高凯,徐慧芳,蔡衍珊,程伟彬,梁彩云,钟斐,韩志刚.  中国艾滋病性病. 2018(06)
[5]云南省德宏傣族景颇族自治州2016年新报告艾滋病病毒感染者的基因亚型分析[J]. 段星,王可然,王继宝,叶润华,王译葵,杨锦,杨涛,周素娟,杨跃诚,姚仕堂,段松,何纳.  中华流行病学杂志. 2018 (05)
[6]云南省德宏傣族景颇族自治州2012-2016年新报告HIV感染者流行病学特征分析[J]. 王继宝,陈晓晨,段星,杨锦,王译葵,杨涛,叶润华,杨跃诚,姚仕堂,蒋岩,段松,何纳.  中华流行病学杂志. 2017 (10)
[7]云南省德宏傣族景颇族自治州2015年新报告HIV感染者亚型分析[J]. 段星,王可然,王继宝,杨涛,王译葵,杨锦,叶润华,杨跃诚,姚仕堂,段松,何纳.  中华流行病学杂志. 2017 (08)
[8]云南省德宏州艾滋病病毒感染者/艾滋病患者阴性配偶HIV新发感染研究[J]. 杨跃诚,张玉成,曹艳芬,唐仁海,杨世江,李林,姚仕堂,叶润华,王继宝,段松,何纳.  中华流行病学杂志. 2016 (04)
[9]绍兴市HIV-1未治疗人群潜在耐药性研究[J]. 傅利军,何婷婷,赵丹燕,胡雪娜,曹栋卿.  中国卫生检验杂志. 2015(23)
[10]钦州市钦南区HIV-1原发性耐药及其影响因素的研究[J]. 沈平,苏齐鉴,黄毅毅,蒋丽萍,张达燕,郭继昌,徐鸿庄,韦建立.  中国热带医学. 2015(10)

博士论文
[1]云南省HIV-1跨境传播特性及亚型演化规律研究[D]. 王炳辉.昆明理工大学 2016
[2]中国云南省HIV/AIDS患者基因变异与耐药的研究[D]. 杨翠先.第三军医大学 2015

硕士论文
[1]2016年昭阳区新报告HIV-1阳性人群基因亚型及耐药性研究[D]. 刘红艳.昆明医科大学 2017
[2]云南和广西HIV-1流行毒株的基因变异和分子进化研究[D]. 陈立力.中国人民解放军军事医学科学院 2011



本文编号：3713197