两个裸燕麦品种AsCSLH基因的克隆及差异分析

发布时间：2023-02-25 19:07

　　本研究通过对24份裸燕麦品种籽粒的β-葡聚糖含量数据进行筛选,得到两个β-葡聚糖含量差异显著的品种,克隆得到这两个品种的β-葡聚糖合成酶(AsCSLH)基因,并对这两个品种中AsCSLH基因的序列进行差异分析及生物信息学分析。主要结果如下:1、24份裸燕麦品种中β-葡聚糖含量在2.5%-7.0%。其中β-葡聚糖含量最低的品种为:‘花早2号’;β-葡聚糖含量最高的品种为:‘内莜6号’。2、克隆得到裸燕麦品种‘花早2号’AsCSLH基因cDNA全长为2277bp,AsCSLH基因gDNA全长为2953bp,由7个外显子和6个内含子组成‘内莜6号’的AsCSLH基因cDNA全长为2277bp,AsCSLH基因gDNA全长为2953bp,由7个外显子和6个内含子组成;生物信息学分析,两个基因序列一致。3、裸燕麦AaCSLH基因共编码758个氨基酸,预测是一个理论等电点为6.8,分子量为83.15kD,具有6个跨膜结构域且无信号肽的亲水性蛋白,其二级结构以α-螺旋(Hh)为主,三级结构预测与二级结构相符。4、裸燕麦AsCSLH基因编码的氨基酸序列与水稻进化关系最远,同源性为63%;与大麦进化关系...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 引言
    1.1 燕麦简介
    1.2 燕麦的价值
    1.3 燕麦中的β-葡聚糖
    1.4 燕麦β-葡聚糖的价值
    1.5 燕麦β-葡聚糖含量影响因素
    1.6 燕麦β-葡聚糖合成机制
    1.7 β-葡聚糖合成相关酶类基因
    1.8 研究目的及意义
2 材料与方法
    2.1 供试材料及处理
        2.1.1 供试材料
        2.1.2 样品处理
    2.2 主要药品、试剂
    2.3 重要仪器设备
    2.4 β-葡聚糖含量检测
    2.5 引物设计与合成
    2.6 燕麦总DNA提取及检测
    2.7 燕麦叶片中总RNA的提取及检测
    2.8 cDNA的获取
    2.9 裸燕麦AsCSLH基因的扩增
        2.9.1 ‘内莜6号'AsCSLH基因cDNA全长和gDNA全长序列的扩增
        2.9.2 ‘花早2号'AsCSLH基因cDNA全长和gDNA全长序列的扩增
    2.10 燕麦AsCSLH基因的生物信息学分析
        2.10.1 多序列比对及序列同源性分析
        2.10.2 蛋白质基本性质分析
        2.10.3 蛋白质结构分析
        2.10.4 系统进化树分析
3 结果与分析
    3.1 试验品种的筛选
    3.2 总RNA的检测结果
    3.3 ‘内莜6号’AsCSLH基因的克隆及序列分析
        3.3.1 ‘内莜6号’AsCSLH基因cDNA全场序列的扩增
        3.3.2 ‘内莜6号’AsCSLH基因gDNA全长序列的扩增
        3.3.3 ‘内莜6号’AsCSLH基因的序列分析
    3.4 ‘花早2号’AsCSLH基因的克隆及序列分析
        3.4.1 ‘花早2号’AsCSLH基因cDNA全场序列的扩增
        3.4.2 ‘花早2号’AsCSLH基因gDNA全长序列的扩增
        3.4.3 ‘花早2号’AsCSLH基因的序列分析
    3.5 两个品种之间AsCSLH基因的比对分析
    3.6 燕麦AsCSLH基因编码蛋白质分析
        3.6.1 燕麦AsCSLH基因编码蛋白质的性质与结构分析
        3.6.2 CSLH基因编码氨基酸序列的系统进化树构建
4 讨论
    4.1 裸燕麦籽粒中β-葡聚糖的分布
    4.2 影响燕麦籽粒中β-葡聚糖含量的因素
        4.2.1 环境因素的影响
        4.2.2 遗传因子的影响
        4.2.3 β-葡聚糖合成机制中的影响
5 结论
致谢
参考文献
作者简介



本文编号：3749026