石榴果皮DHQ/SDH基因的克隆及序列分析

发布时间：2023-03-04 08:30

　　以泰山红石榴果实为试验材料,利用逆转录PCR(RT-PCR)技术扩增出980 bp大小的中间片段,用3’c DNA末端快速扩增PCR(RACE PCR)获得DHQ/SDH基因的3’端,拼接后获得1 585 bp的c DNA片段。结果表明,该基因含有1 265 bp编码序列(CDS),编码421个氨基酸,其氨基酸序列与苹果(注册号:XP₀08370537.1)、葡萄(注册号:XP₀02270232.1)、白梨(注册号:XP₀09335660.1)的同源性分别为82%、84%、82%;蛋白质理论分子质量为133 682.2 u,等电点为5.01,含量最丰富的氨基酸是丙氨酸(Ala)、半胱氨酸(Cys)、甘氨酸(Gly)、苏氨酸(Thr),具有DHQase I、SDH(Aro E)2个保守结构域,为亲水性蛋白;二级结构主要由无规则卷曲(31.12%)、α-螺旋(30.17%)、伸展链(24.94%)和β-转角(13.78%)组成;Gen Bank登录号为KU133479。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 总RNA提取和c DNA第1链的合成
        1.2.2 基因中间片段的克隆
        1.2.3 3'c DNA末端快速扩增PCR(RACE PCR)获得基因的3'端序列
        1.2.4 DHQ/SDH基因的生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 石榴果皮DHQ/SDH基因保守片段的克隆
    2.2 石榴果皮DHQ/SDH基因3'端序列的克隆
    2.3 DHQ/SDH基因的生物信息学分析
        2.3.1 DHQ/SDH基因编码蛋白的理化性质、疏/亲水性分析
        2.3.2 DHQ/SDH基因编码蛋白的二级结构分析
3 讨论与结论



本文编号：3754057