异基因造血干细胞移植后供受者嵌合状态自动分析和监测平台的开发和应用

发布时间：2023-04-06 18:27

　　目的:开发一套基于短串联重复序列(STR)标记和毛细管电泳法进行异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)后嵌合率检测时可自动数据分析和报告的工具软件,以提高工作效率。方法:采用Apache+MySQL+PHP+HTML5技术搭建数据库和访问界面,根据基于STR和毛细管电泳法判别STR位点基因型和计算嵌合率的规则设定分析逻辑和流程。抽取100例allo-HSCT患者的STR分型和移植后194次嵌合率检测数据,应用此平台进行自动STR位点分型鉴定、嵌合率计算及生成报告。结果:所搭建的分析平台可实现自定义STR位点、基因型智能识别、嵌合比例自动分析、检测信息数据库化管理,可自动生成含该患者多次检测、多种不同成分细胞嵌合比例结果的整合报告和嵌合比例趋势图等功能,并且可通过浏览器多用户同时访问和使用。应用该平台自动分析和有经验人员的手工分析结果完全一致,并且通过自动化减少了手工分析失误的可能。使用该平台自动分析所用时间约为手工分析的1/6-1/5。结论:本研究搭建的嵌合率自动分析平台运行稳定、位点分型和嵌合率分析结果可信,可提高工作效率和报告内涵,具有推广应用价值。

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
材料和方法
    病例资料
    嵌合率检测实验流程
    位点鉴定算法
    嵌合率算法
    涉及stutter峰修正情况的算法
    分析流程和平台搭建
    数据源
    自定义分析位点
    STR位点基因型智能识别
    嵌合结果自动分析
    自动生成含多次检测结果的整合报告和嵌合比例趋势图
    平台使用流程
    平台效能评估
结果
    病例收集
    平台评估结果
讨论



本文编号：3784186