源自野生二粒小麦高籽粒蛋白含量的候选基因分析
发布时间：2023-04-29 18:23
小麦籽粒蛋白含量(GPC)与小麦营养和加工品质密切相关。但是,由于小麦GPC和产量的负相关性,在长期聚焦高产的育种目标指导下,致使现代育成普通小麦品种的GPC较低。野生二粒小麦(Triticum turgidum ssp.dicoccoides,2n=4x=28,AABB)具有高GPC特性,并能通过远缘杂交提高普通小麦的GPC,但由于GPC这一性状的复杂性,使得GPC相关候选基因的研究进展缓慢。前人研究表明,NAM-B1基因与GPC密切相关。本课题前期研究发现,以含有功能型NAM-B1基因的野生二粒小麦D1和D97为父本,分别与不含功能型NAM-B1基因的低蛋白弱筋普通小麦品种(Triticum aestivum,2n=6x=42,AABBDD)川农16(CN16)杂交并连续自交获得的稳定高世代株系中,BAd107-4(CN16×D1)含有功能型NAM-B1基因,并且含有高的GPC;BAd7-209(CN16×D97)不含功能型NAM-B1基因,却仍然具有较高的GPC;BAd23-1(CN16×D97)不含有功能型NAM-B1基因,具有低的GPC。可见,在野生二粒小麦中还具有NAM-B...
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 小麦及小麦籽粒蛋白含量的重要性
1.2 小麦籽粒蛋白含量相关的基因和QTL定位
1.3 野生二粒小麦的重要性
1.4 野生二粒小麦远缘杂交对普通小麦籽粒蛋白含量的改良
1.5 野生二粒小麦中与籽粒蛋白含量相关位点的研究
1.6 二代测序技术
1.7 二代测序技术在小麦候选基因发掘上的应用
1.8 蛋白互作网络
1.9 本研究的目的与意义
第二章 野生二粒小麦D1渐渗系的籽粒蛋白含量相关的候选基因分析
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 RNA提取、文库构建以及Illumina测序
2.2.3 农艺性状调查和籽粒蛋白含量的测定
2.2.4 测序数据的质控和过滤
2.2.5 基因表达水平分析
2.2.6 RNA-seq相关性分析
2.2.7 基因差异表达分析
2.2.8 差异表达基因的功能注释
2.2.9 qRT-PCR的表达验证以及引物设计
2.2.10 蛋白互作网络的构建
2.3 结果
2.3.1 BAd107-4 及亲本农艺性状和籽粒蛋白含量分析
2.3.2 BAd107-4 及亲本灌浆期籽粒转录组分析
2.3.3 中国春作为参考基因组的转录组分析
2.3.4 野生二粒小麦作为参考基因组的转录组分析
2.3.5 籽粒蛋白含量密切相关的候选基因
2.4 讨论
2.4.1 野生二粒小麦D1 丰富的籽粒蛋白相关位点及其向普通小麦的整合效应
2.4.2 野生二粒小麦D1中特异的氮素代谢相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
2.4.3 野生二粒小麦优异的储藏蛋白基因对普通小麦籽粒蛋白的影响
第三章 野生二粒小麦D97渐渗系高籽粒蛋白含量的候选基因分析
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 RNA提取、文库构建以及Illumina测序
3.2.3 农艺性状调查和籽粒蛋白含量测定
3.2.4 测序数据的质控和过滤
3.2.5 基因表达水平分析
3.2.6 RNA-seq相关性分析
3.2.7 基因差异表达分析
3.2.8 差异表达基因的功能注释
3.2.9 qRT-PCR的表达验证以及引物设计
3.2.10 蛋白互作网络的构建
3.3 结果
3.3.1 田间农艺性状调查
3.3.2 BAd7-209、BAd23-1及其亲本灌浆期籽粒转录组分析
3.3.3 以中国春为参考基因组的差异基因分析
3.3.4 以野生二粒小麦为参考基因组的差异基因分析
3.3.5 籽粒蛋白含量密切相关的候选基因
3.3.6 qRT-PCR验证
3.4 讨论
3.4.1 源自D97 籽粒蛋白含量相关的候选基因
3.4.2 蛋白质在内质网上的加工相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.3 蛋白质转换,翻译后修饰,分子伴侣相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.4 储藏蛋白基因对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.5 D1和D97 及其后代的小麦籽粒蛋白含量形成机制比较
3.5 结论
3.6 创新性
参考文献
致谢
作者简历
本文编号：3805502
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1.1 小麦及小麦籽粒蛋白含量的重要性
1.2 小麦籽粒蛋白含量相关的基因和QTL定位
1.3 野生二粒小麦的重要性
1.4 野生二粒小麦远缘杂交对普通小麦籽粒蛋白含量的改良
1.5 野生二粒小麦中与籽粒蛋白含量相关位点的研究
1.6 二代测序技术
1.7 二代测序技术在小麦候选基因发掘上的应用
1.8 蛋白互作网络
1.9 本研究的目的与意义
第二章 野生二粒小麦D1渐渗系的籽粒蛋白含量相关的候选基因分析
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 RNA提取、文库构建以及Illumina测序
2.2.3 农艺性状调查和籽粒蛋白含量的测定
2.2.4 测序数据的质控和过滤
2.2.5 基因表达水平分析
2.2.6 RNA-seq相关性分析
2.2.7 基因差异表达分析
2.2.8 差异表达基因的功能注释
2.2.9 qRT-PCR的表达验证以及引物设计
2.2.10 蛋白互作网络的构建
2.3 结果
2.3.1 BAd107-4 及亲本农艺性状和籽粒蛋白含量分析
2.3.2 BAd107-4 及亲本灌浆期籽粒转录组分析
2.3.3 中国春作为参考基因组的转录组分析
2.3.4 野生二粒小麦作为参考基因组的转录组分析
2.3.5 籽粒蛋白含量密切相关的候选基因
2.4 讨论
2.4.1 野生二粒小麦D1 丰富的籽粒蛋白相关位点及其向普通小麦的整合效应
2.4.2 野生二粒小麦D1中特异的氮素代谢相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
2.4.3 野生二粒小麦优异的储藏蛋白基因对普通小麦籽粒蛋白的影响
第三章 野生二粒小麦D97渐渗系高籽粒蛋白含量的候选基因分析
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 RNA提取、文库构建以及Illumina测序
3.2.3 农艺性状调查和籽粒蛋白含量测定
3.2.4 测序数据的质控和过滤
3.2.5 基因表达水平分析
3.2.6 RNA-seq相关性分析
3.2.7 基因差异表达分析
3.2.8 差异表达基因的功能注释
3.2.9 qRT-PCR的表达验证以及引物设计
3.2.10 蛋白互作网络的构建
3.3 结果
3.3.1 田间农艺性状调查
3.3.2 BAd7-209、BAd23-1及其亲本灌浆期籽粒转录组分析
3.3.3 以中国春为参考基因组的差异基因分析
3.3.4 以野生二粒小麦为参考基因组的差异基因分析
3.3.5 籽粒蛋白含量密切相关的候选基因
3.3.6 qRT-PCR验证
3.4 讨论
3.4.1 源自D97 籽粒蛋白含量相关的候选基因
3.4.2 蛋白质在内质网上的加工相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.3 蛋白质转换,翻译后修饰,分子伴侣相关基因及其对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.4 储藏蛋白基因对普通小麦籽粒蛋白的影响
3.4.5 D1和D97 及其后代的小麦籽粒蛋白含量形成机制比较
3.5 结论
3.6 创新性
参考文献
致谢
作者简历
本文编号：3805502
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3805502.html
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