谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS标记开发
发布时间:2023-10-15 15:17
谷子是中国北方重要的耐旱杂粮作物。胁迫相关蛋白是一类具有A20和(或) AN1结构域的锌指蛋白,广泛参与植物对非生物胁迫的响应。本研究从‘晋谷20’中克隆得到谷子SiSAP8基因,该基因编码区513 bp,编码170个氨基酸,分子量为18.20 kD,等电点为8.28,包含1个A20和1个AN1结构域。在对该基因序列进行多态性分析,共发现5个SNP位点和1个InDel,其中编码区有1处核苷酸变异位点(G/T)为非同义突变,使得缬氨酸变成了苯丙氨酸。利用第81位的SNP位点(A/G)开发了dCAPS标记,命名为‘SNP-81’,该标记的开发为后期功能鉴定及关联分析提供了依据。
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 结果与分析
1.1 SiSAP8基因的克隆
1.2 SiSAP8氨基酸序列的同源性分析及进化分析
1.3 SiSAP8序列的多态性分析
1.4 SiSAP8的dCAPS标记开发
2 讨论
3 材料与方法
3.1 试验材料
3.2 目标基因的克隆
3.3 目标基因序列的多态性分析
3.4 dCAPS标记的开发
作者贡献
本文编号:3854153
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 结果与分析
1.1 SiSAP8基因的克隆
1.2 SiSAP8氨基酸序列的同源性分析及进化分析
1.3 SiSAP8序列的多态性分析
1.4 SiSAP8的dCAPS标记开发
2 讨论
3 材料与方法
3.1 试验材料
3.2 目标基因的克隆
3.3 目标基因序列的多态性分析
3.4 dCAPS标记的开发
作者贡献
本文编号:3854153
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