桃PIN蛋白基因家族鉴定及其在不同树型桃中的表达分析

发布时间：2023-12-07 19:49

　　生长素外向转运体PIN (PIN-FORMED)蛋白是一种典型的跨膜运输蛋白,通过参与植物体内生长素的极性运输进而在植物的生长发育过程中发挥重要作用。为弄清PIN蛋白在桃(Prunus persica)基因组中的分布、结构及进化,研究家族成员在不同树型桃中的表达特性,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)已知的8个PIN蛋白和Mem_trans (PF03547)保守域从桃全基因组中进行桃PIN蛋白基因家族成员鉴定,并利用TBtools v0.6733、GSDS 2.0、MEME 4.9、Protparam V12.1、MEGA 7.0、PlantCARE等生物信息学软件对鉴定到的PpPIN蛋白基因家族成员进行染色体定位、基因结构、蛋白质理化性质、motif基序、系统进化和启动子顺式作用元件分析;基于转录组测序结果和q RT-PCR对PpPINs基因在不同树型桃中的表达特性进行分析。本研究鉴定出15个PpPIN蛋白基因家族成员;15个PpPIN基因不均匀分布在桃6条染色体上,除PpPIN3和PpPIN5外,其余的PpPIN基因均含有内含子,内含子数量...

【文章页数】：14 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 桃PIN蛋白基因家族成员鉴定
    1.3 桃PIN蛋白基因家族相关生物信息学分析及进化树构建
    1.4 桃PIN蛋白家族基因在不同树型桃中表达分析
    1.5 实时荧光定量PCR (q RT-PCR)
    1.6 数据统计与分析
2 结果与分析
    2.1 桃PIN蛋白基因家族鉴定及序列分析
    2.2 桃PIN蛋白家族系统进化分析
    2.3 桃PIN蛋白基因家族motif序列和基因结构分析
    2.4 桃PIN蛋白基因家族启动子元件分析
    2.5 桃PIN蛋白基因家族表达分析
3 讨论
4 结论



本文编号：3870966