2013-2015年江苏省腮腺炎病毒基因特征和G基因型病毒株全基因序列分析

发布时间：2024-03-05 23:17

　　目的分析江苏省腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)流行株SH基因特征和G基因型MuV全基因序列特征。方法对江苏省2013-2015年流行性腮腺炎病例的咽拭子标本进行MuV分离和基因分型,分析F和G基因型MuV的SH基因特征;对G基因型MuV进行全基因序列测定和拼接,重点分析F、HN和N蛋白基因特征。结果共获得2013-2015年178株F基因型和6株G基因型MuV流行株。SH基因亲缘关系树显示,F、G基因型流行株与其参考株之间核苷酸遗传距离分别为0.048-0.010、0.032-0.054,且G基因型形成两个独立分支。全基因序列分析显示,G基因型MuV的HN蛋白出现N-糖基化位点增加或减少,发生HN蛋白E356D、Y442S、I279T和I287V变异、N蛋白L457A、T466N、M492I和N495H变异以及F蛋白K101R变异。结论江苏省2013-2015年MuV流行株以F基因型为主;并发现G基因型MuV且发生一定变异。

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【部分图文】：

图1江苏省2013-2015年MuV流行株SH基因亲缘关系树

5株G基因型MuV流行株全基因序列测定成功，基因组全长均为15345个核苷酸，未发现核苷酸或氨基酸插入和缺失，其全基因组与A基因型疫苗株（JL株、S79株）、其他国家G基因型、N基因型MuV的核苷酸平均遗传距离分别为0.069、0.014、0.041。将5株MuV全基因组....

图2江苏省2013-2015年G基因型MuV全基因组亲缘关系树

图1江苏省2013-2015年MuV流行株SH基因亲缘关系树以JL(AF338106）、S79(HQ416906）疫苗株为参考株，5株G基因型MuV流行株的全基因序列有129-131个氨基酸位点变异，与JL株、S79疫苗株均存在25个N-糖基化位点，其中HN蛋白的N12S变....

本文编号：3920192