番茄转录因子基因SlWRKY16的克隆及原核表达分析
发布时间:2024-03-21 03:51
从栽培番茄(Solanumlycopersicum)‘M82’中克隆到1个WRKY家族基因SlWRKY16。研究结果显示:SlWRKY16包含1 497 bp的完整开放读码框,编码498个氨基酸,理论分子量为55.5 kD,含有1个WRKYGQK保守结构域和C2H2锌指结构域,属于Ⅱb类WRKY转录因子基因,且定位于细胞膜上;栽培番茄Sl WRKY16与潘那利番茄Sp WRKY6(XP015064265.1)、马铃薯St WRKY6(XP006350473.1)同源性最高。qRT-PCR结果显示SlWRKY16在番茄不同组织中均有表达,叶片中的表达量最高;短时间非生物胁迫下该基因的表达量显著降低。此外,重组菌pET-30a-SlWRKY16在NaCl、甘露醇胁迫下生长均明显低于对照菌pET-30a。综上,番茄SlWRKY16基因可能在响应非生物胁迫过程中具有负调控效应。
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【部分图文】:
本文编号:3933785
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图1番茄SlWRKY16的PCR扩增
SlWRKY16的启动子区含有大量光响应元件和ABA、赤霉素、茉莉酸甲酯等激素响应元件(表2),暗示其可能是1个诱导型启动子,受光等因素诱导表达,进而参与非生物胁迫响应。SlWRKY16包含498个氨基酸,理论分子量约为55.5kD,等电点为8.17,推测的分子式为C2389H....
图2SlWRKY16与不同物种WRKY转录因子氨基酸序列多重比对
对SlWRKY16及19个同源序列进行比对,并用MEGA5.0构建进化树。结果(图3)显示:SlWRKY16与潘那利番茄SpWRKY6(XP_015064265.1)高度同源(97.85%),其次马铃薯StWRKY6(XP_006350473.1,92%),与美花烟草NsWRK....
图3SlWRKY16与其他植物WRKY蛋白质的系统进化树分析
为了进一步探索了SlWRKY16在栽培番茄‘M82’不同组织以及受盐和干旱胁迫的诱导下的表达情况,qRT-PCR分析结果显示,该基因在根、茎、叶中均有表达,且叶片中表达量最高(图5,A);在200mmol·L-1NaCl或15%PEG6000的5h短时间胁迫下,SlWRKY....
图4SlWRKY16的亚细胞定位
图3SlWRKY16与其他植物WRKY蛋白质的系统进化树分析图5SlWRKY16的转录表达模式分析
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