苹果砧木不定根发育转录组及候选基因MdRRs和MdCRFs筛选与表达分析

发布时间：2024-04-20 03:11

　　不定根发育在苹果砧木无性繁殖中起着重要作用。目前,不定根发育研究主要集中在发育过程的解剖学观察、内源激素水平检测、相关基因克隆、表达和功能分析,以及不定根调控技术的开发等,不定根发育过程中基因共表达调控网络尚未得到很好的确立。为深入研究不定根形成的分子机理,解析不定根发育过程中的基因调控网络,挖掘关键候选基因,本研究以苹果砧木‘T337’组培苗为试材,测定内源激素含量,对不定根发生过程进行细胞水平的结构观察,关键时期进行了转录组测序,并对筛选出的候选基因家族成员进行了系统鉴定,利用RT-qPCR检测其在不同组织和不同发育时期的表达模式,为进一步研究苹果砧木不定根发育分子机理奠定基础。研究结果如下:1确定了苹果砧木‘T337’不定根的发育过程的3个关键时期:形成层细胞分裂期(3-5 d),不定根原基形成期(5-7d),不定根的分化形成期(9-11d)。外源IBA处理显著诱导了内源激素含量变化,其中AUX和BR在S2的含量显著上调;CTK和JA在S3的含量也显著上调;GA和ABA在S4含量显著下调;对不定根发育4个关键时期高通量测序,共鉴定出4294个与激素、糖信号、机械伤信号、细胞周期诱...

【文章页数】：102 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2-1苹果砧木‘T337’不定根形成过程变化和解剖观察注：AR形成的时间过程：S1（阶段1）表示茎基部接入生根培养基（0d）;S2（阶段2）表示茎基

第二章苹果砧木不定根发育的转录组152.3结果与分析2.3.1苹果砧‘T337’不定根生过程的形态学观察在对照处理条件下苹果砧木‘T337’在4个时期不产生不定根（图2-1）。在IBA处理条件下，苹果砧木‘T337’在S4时期形成愈伤组织并分化为根（图2....

图2-2不定根形成过程中苹果砧木‘T337’茎基部（生根区）中的激素含量和激素比变化

表现出先上升后下降的变化趋势（图2-2A）。赤霉素（GA）在S2时含量最高（图2-2A）。脱落酸（ABA）在S1时的含量较低，而在S2，S3和S4时期差异不显著（图2-2A）。油菜素内酯（BR）在S3时含量最高，从S3到S4显著下降28%。茉莉素....

图2-4苹果砧木‘T337’不定根形成过程中生长素相关的差异基因的表达模式

苹果砧木不定根发育转录组及候选基因MdRRs和MdCRFs筛选与表达分析20IBA处理条件下，ARF9相对表达水平从S1到S2的表现出显著性上调（图2-4B)。ARF1和ARF11的相对表达水平从S2到S3显著性下调（图2-4B)。PIN1....

图2-5苹果砧木‘T337’不定根形成过程中细胞分裂素相关差异基因在茎基部的表达模式

鉴定与细胞分裂素相关的差异表达基因可见附录：表S5。代表性的基因包括细胞分裂素响应因子（CRF4)，细胞分裂素氧化酶基因（CKX7)，组氨酸基酶1（AHK1)和细胞分裂素响应因子1（GATA1)等。将筛选的差异表达基因进行聚类分析（图2-5A），并在不定根形成期间使用R....

本文编号：3958785