三角褐指藻pds基因生物信息学与诱导表达分析

发布时间：2024-12-11 21:45

　　 岩藻黄素是一类具有重要药用价值和开发价值的新型海洋药物,八氢番茄红素脱氢酶（PDS）是三角褐指藻类岩藻黄素生物合成途径中的一个重要的限速酶。为了更好地开发和利用岩藻黄素,通过RT-PCR克隆了三角褐指藻pds基因（Ptpds,Gen Bank序号:XM₀02184476.1）c DNA全长序列,并从基因层面分析了外源诱导子对岩藻黄素生物合成的诱导机制,进一步探究Ptpds的结构和表达特性。结果表明,Ptpds基因cDNA全长2 442 bp,开放阅读框（ORF）为1 773 bp,编码589个氨基酸,并含有一个NAD（P）-binding结构域;蛋白分子结构预测结果表明,三角褐指藻PDS蛋白（PtPDS）分子呈亲水性,含有转运肽、信号肽、跨膜结构域等结构。系统进化树分析显示,PtPDS与新型微藻的PDS蛋白亲缘关系较近,且在所选取的藻类中进化地位较为原始。诱导表达结果表明,Me JA、ASA、AA、ACS等4种诱导子均能促进Ptpds基因的表达,且在4种诱导子处理下,三角褐指藻中的岩藻黄素含量变化与Ptpds基因的表达水平变化呈现高度的一致性,说明Ptpds基因是...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 三角褐指藻的培养与处理
    1.2 三角褐指藻总RNA的提取及基因序列的获得
    1.3 三角褐指藻pds基因生物信息学分析
    1.4 4种诱导子对三角褐指藻pds基因转录的影响
    1.5 岩藻黄素的提取及含量测定
2 结果与分析
    2.1 三角褐指藻pds基因序列分析
    2.2 三角褐指藻PDS蛋白 (Pt PDS) 的生物信息学分析
    2.3 4种诱导子对三角褐指藻岩藻黄素含量以及pds基因表达水平的影响
3 讨论
4 结论



本文编号：4016326