基于联合测序的燕麦光周期不敏感基因挖掘

发布时间：2025-01-01 09:26

　　光是重要的环境因子,参与植物不同的生理过程,调控植物的生长和发育。植物对昼夜长短的生理反应称为光周期现象。根据日照长度和开花时间的关系,植物可以分为长日照、短日照和日中性植物。燕麦是一种分布于世界范围内的粮饲兼用作物,作为长日照植物,抽穗结实需要日照时长超过其临界日长。对日照长度的需求限制了燕麦的熟期及适种范围,影响了燕麦的产量。本研究选用对光周期不敏感品种gp012和对光周期敏感的品种红旗2号作为试验材料,对两个品种在短日照条件下的茎尖形态进行了观察,并以叶片和茎尖构建了 Illumina和Pacbio转录组数据库,分析并挖掘了燕麦光周期不敏感的候选基因。主要结果如下:1、12h日照生长条件下,光周期不敏感品种gp012的茎尖形态没有明显变化,光周期敏感品种红旗2号的茎尖组织在生长过程中逐渐干瘪萎缩,导致红旗2号不能抽穗结实。2、Illumina 测序共得到 63.63 Gb Clean Data,Q30 达到 90.32%,Pacbio 测序测得数据11.62 Gb,通过Illumina测序数据校正Pacbio测序数据并筛选出差异转录本。最后得到去冗余的60,673条转录本序列。3、...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１拟南芥节律钟的简化模型［３１］??．?．?．?［３１］??Ｆｉｇｕｒｅ?１?Ａ?ｓｉｍｐｌｉｆｉｅｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ?ｃｉｒｃａｄｉａｎ?ｃｌｏｃｋ??

内蒙古农业大学硕士学位论文子，而?Ｔ０Ｃ１?又称为?ＰＲＲ１，是?ｐｓｅｕｄｏ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ?ｒｅｇｕｌａｔｏｒ?（ＰＲＲ）家族ＣＡ１／ＬＨＹ和Ｔ０Ｃ１在一天之中相互抑制，ＣＣＡ１／ＬＨＹ的表达水平在黎而Ｔ０Ｃ１的表达峰值则出现在黄昏。ＣＣＡ１／ＬＨＹ的表达水平在黎明后Ｔ０Ｃ....

图３技术路线图??Ｆｉｇｕｒｅ?３?Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ??

基于联合测序的燕麦光周期不敏感基因挖掘术路线??

图4生物信息学分析流程

内蒙古农业大学硕士学位论文?１Ｊ＿??４）三代文库构建使用ＳＭＡＲＴｅｒ？?ＰＣＲ?ｃＤＮＡ?Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?Ｋｉｔ合成ｍＲＮＡ的全长??ＮＡ。使用ＢｌｕｅＰｉｐｐｉｎ筛选全长ｃＤＮＡ片段，构建不同大小的ｃＤＮＡ文库。随后??次ＰＣＲ扩增放大筛选的全长ｃＤＮＡ，并对全长ｃＤＮ....

图５?ｇＰ０１２?（Ａ）和红旗２号（Ｂ）茎尖在１２ｈ条件下形态观察??Ｆｉｇｕｒｅ?５?Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ?ｃｈａｎｇｅｓ?ｏｆ?ＭＳＡ?ｏｆ?ｇｐ０１２?（Ａ）?ａｎｄ?Ｈ０ＮＧＱＩ２?（Ｂ）?ｕｎｄｅｒ?１２ｈ?ｗｅｒｅ?ｏｂｓｅｒｖｅｄ??

内蒙古农业大学硕士学位论文分析??茎尖形态观察??探究光照时长对燕麦生长发育的影响，我们通过扫描电录其在１２ｈ日照条件下的形态变化。光周期不敏感品种没有明显变化，能够正常生长发育。光周期敏感品种红，从二棱期呈现出干瘪萎缩的状态。这种变化可能在茎最终在二棱期的时候出现了表型上的差异....

本文编号：4022384