西瓜高密度遗传图谱构建及三个果实性状相关候选基因的精细定位

发布时间：2025-04-11 02:56

　　西瓜(Citrullus lanatus)是一种在世界范围内广泛种植的园艺作物,中国是西瓜最大的生产国和消费国,其果实相关性状是育种工作的重点。现有的西瓜遗传图谱标记饱和度较低,且作图群体多为临时性分离群体,限制了西瓜重要农艺性状的基因/QTL定位研究。本研究通过对重组自交系(Recombinant inbreed line,RIL)群体进行全基因组重测序,利用重组bin构建了一张西瓜高密度遗传图谱。对西瓜果皮颜色、种皮颜色和果实苦味3个性状进行了初定位分析,并通过后续精细定位等过程进行候选基因的确定。获得的主要结果如下:1.以西瓜自交系‘9904’和‘Handel’为亲本经过七代连续自交,创制了含126个单株的重组自交系群体。通过对RIL群体和亲本进行全基因组重测序构建了一张西瓜高密度遗传图谱。图谱包含11个连锁群,总长度1508.94 cM,由2 132个重组bin标记组成,平均图距0.74 cM。对西瓜果皮颜色、种皮颜色、果实苦味等质量性状基因进行了初定位。果皮颜色、种皮颜色、果实苦味各定位到一个显著性位点,分别位于8、3和1号染色体上。2.对控制果皮颜色(墨绿色vs浅绿色)的候选...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1.1技术路线

院硕士学位论文第.,2016；Shangetal.,2016；Liuetal.,2016）。但这些图谱大都基于简化基因度相对不足，作图群体多为临时性分离群体，不能进行重复试验，影响后性。究中，我们不仅对亲本进行了高覆盖深度的测序，同时对重组自交系进行通过对重组自交....

图2.1西瓜遗传图谱作图亲本和重组自交系表型Fig.2.1PhenotypeoftheparentallinesandRILs注：A为亲本果皮颜色表型，B为亲本种皮颜色表型，C为重组自交系种皮颜色表型Note:Arepresentsthephenotypeoftherindcolorinparentallines,Brepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinparentallines.CrepresentsthephenotypeoftheseedcoatcolorinRILspopulation.

硕士学位论文第二章西瓜高密度第二章西瓜高密度遗传图谱的构建方法本及群体9904’和‘Handel’）为来自中国农业科学院郑州果树研究所多倍体料。‘9904’来源于栽培种（C.lanatussubsp.vulgaris）JW和黏籽西瓜（spermus）杂交,并经过多代....

图2.2西瓜高密度遗传图谱

图2.3遗传图谱与参考基因组的共线性图

为了评估构建的遗传图谱的质量，将所有重组bin定位到参考基因组‘97103’上进行共线性分析。图2.3遗传图谱与参考基因组的共线性图Fig.2.3Relationshipbetweengeneticandphysicalpositionswitheach....

本文编号：4039395