洋葱AcLOX1基因的克隆及其表达分析

发布时间：2017-06-25 00:11

  本文关键词：洋葱AcLOX1基因的克隆及其表达分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)是植物十八碳酸代谢途径的关键酶,与种子老化密切相关。洋葱(Allium cepa)种子为短寿命种子。研究LOX基因与洋葱种子发育及老化的关系具有重要的意义。本研究以洋葱授粉后的子房和种子为材料,利用RT-PCR结合快速克隆c DNA末端(rapid-amplification of c DNA ends,RACE)技术,获得Ac LOX1(Gen Bank登录号:KU363822)基因全长。用生物信息学方法对其基因序列特征进行分析;利用RT-PCR和q RT-PCR分析Ac LOX1在洋葱不同部位、种子发育过程以及种子储存过程中的表达模式。结果表明,该基因全长为2 847 bp,包含一个2 619 bp的开放阅读框,编码873个氨基酸。氨基酸序列分析表明,Ac LOX1具有PLAT_LH2(polycystin-1,lipoxygenase,alpha-toxin_lipoxygenase homology)和LOX两种结构域;与桉树(Eucalyptus grandis)、杏(Prunus dulcis)、葡萄(Vitis vinifera)等物种的LOX基因氨基酸序列同源性高达66%~73%。系统进化树分析表明,Ac LOX1与其他物种的9-LOX聚在一起。时空表达模式表明,Ac LOX1基因在洋葱各组织中均有表达,在授粉后5~25 d随着时间增长其表达量增加,但在授粉后25 d到成熟及储存一年的种子中少量持续表达。本实验初步证实了Ac LOX1对洋葱种子发育具有促进作用且与种子老化相关联,为阐明洋葱种子短寿命的作用机制提供了理论依据。
【作者单位】： 湖南农业大学园艺园林学院;北京农林科学院蔬菜研究中心/农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;
【关键词】： 洋葱 种子老化 洋葱脂氧合酶基因(AcLOX) 克隆 功能分析
【基金】：国家自然科学基金(No.31372066) 北京市自然科学基金(No.6132016) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(No.KJCX2014011)
【分类号】：S633.2
【正文快照】： 北京100097洋葱(Allium cepa)为葱科(Alliaceae)葱属(Alli-um)二年生草本植物,在我国南北各地均有栽培,是我国重要的出口蔬菜之一。由于洋葱种子为短寿命种子(屈冬玉,李树德,2001),严重影响洋葱产业的发展,因此研究种子老化机制对提高种子活力和实际生产具有重要意义。关于葱

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本文编号：480056