利用宏基因组法筛选新几丁质酶基因

发布时间：2017-07-16 11:10

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【摘要】：为了寻找新型几丁质酶编码基因,提取了汕头湾海域海底表层沉积物中微生物的宏基因组,采用PCR-DGGE技术扩增和分离获得了新型几丁质酶基因编码信息。实验共得到63条几丁质酶基因片段,其编码的蛋白序列与NCBI数据库收录的序列相似率在41%~97%之间,且大多数在70%以下,只有8条相似率在70%以上,NCBI数据库中与其相似性最高的几丁质酶蛋白序列有18个种属,其中与橙色滑柱菌株(Herpetosiphon aurantiacus)ATCC 23779的几丁质酶存在着最高相似性的序列有27条,另外,与未可培养细菌几丁质酶基因片段相似的有22条,占34.9%,分属9个种属。说明汕头湾表层沉积物中存在多种几丁质酶编码基因,其中有很多是尚未研究的,为寻找新型的几丁质酶编码基因提供了有力的生物资源。
【作者单位】： 徐州生物工程职业技术学院;汕头大学生物系;
【关键词】： 汕头湾 几丁质酶 DGGE 宏基因组 表层沉积物
【分类号】：Q78
【正文快照】： 海洋环境中会产生大量的几丁质沉积,所以降解几丁质就成了很多海洋细菌必不可少的特性,几丁质酶基因在海洋细菌中分布十分广泛,几丁质编码基因资源非常丰富,但是99%的微生物都是不可培养的,给获取几丁质基因带来了巨大的困难。采用宏基因组法可以绕过微生物的培养环节直接研究

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