基于基因簇判别的人类miRNA功能预测研究

发布时间：2017-07-18 05:29

  本文关键词：基于基因簇判别的人类miRNA功能预测研究

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【摘要】：随着新一代测序技术的不断发展,面对海量的序列数据,如果仅靠生物实验的方法来挖掘微RNA(microRNA,miRNA)的基因功能似乎不可能,因此,通过判别新miRNA家族归属来预测其相关生物学功能为实际生物实验的研究开辟新的思路。该文运用基因簇判别方法,基于原始家族信息,对未确定家族归属或新发现的miRNA进行判别,确定其基因家族。研究发现,同一家族的成熟体miRNA成员序列之间存在高度相似性,并且参与相同的调控通路或作用于相同的靶基因,具有相似的生物学功能。因此,通过基因簇判别预测新miRNA家族归属,对新miRNA的基因表达实验与验证具有十分重要的指导意义。
【作者单位】： 江南大学理学院;
【关键词】： miRNA miRNA家族 基因簇判别 K-折交叉验证
【基金】：国家自然科学基金(批准号:11271163) 江苏省研究生科研创新计划项目(批准号:KYZZ16_0309)资助的课题~~
【分类号】：Q522
【正文快照】： 微RNA(micro RNA,mi RNA)是一类内源性长约19~24个核苷酸的非编码单链RNA,进化中具有高度保守性,在转录后水平调控基因的表达,从而在生物过程中发挥重要的作用。生物信息学分析也表明,人类全部基因的1/3都受到mi RNA的调控。研究发现,mi RNA能够特异性和靶m RNA的不精确互补配

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 唐峰波;杨铭;;MiR-200家族与消化道肿瘤的相关研究[J];中华临床医师杂志(电子版);2016年01期

2 李艳芳;王钰;李济洪;;几种交叉验证检验的可重复性[J];太原师范学院学报(自然科学版);2013年04期

3 接智慧;吴建磊;陶陶;史春雪;王敏;;miR-17～92基因簇在宫颈癌、子宫内膜癌与卵巢癌多种细胞系中的表达及意义[J];中国医科大学学报;2013年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前9条

1 丁涛;高洁;;基于基因簇判别的人类miRNA功能预测研究[J];中国细胞生物学学报;2016年12期

2 邱胜华;刘健;陈运平;郭洪娜;;循环型m icroRNA-92a在先天性巨结肠中的表达及上调CDX2基因的研究[J];中国现代医学杂志;2016年21期

3 沈阿灵;刘丽雅;齐飞;陈宏伟;魏丽慧;林久茂;蔡巧燕;彭军;;片仔癀上调miR-200a抑制大肠癌耐药细胞转移的作用机制[J];中华中医药杂志;2016年09期

4 接智慧;吴建磊;王敏;;miR-17～92基因簇过表达调控PTEN、BIM蛋白对卵巢癌SKOV3细胞紫杉醇耐药的影响[J];现代妇产科进展;2016年07期

5 谷有众;高卫东;卢雨正;刘建立;杨瑞华;;应用遗传算法优化支持向量回归机的喷气涡流纺纱线质量预测[J];纺织学报;2016年07期

6 孔志伟;全晓广;周美娟;;HE4、CA125、CA153联合CA199检测在妇科肿瘤诊疗中的应用[J];齐齐哈尔医学院学报;2016年13期

7 谷有众;刘建立;高卫东;;基于遗传模拟退火神经网络的纱线强力预测[J];上海纺织科技;2016年01期

8 陈丽娟;陈建琴;张浩伟;赵峰;王秀秀;王渠源;;miRNA-92在妇科肿瘤中的研究进展[J];中国妇幼保健;2015年16期

9 张萍;王敏;接智慧;双婷;闫效宇;周莹莹;吴建磊;;miR-210在化疗耐药与化疗敏感卵巢浆液性癌组织中的检测及意义[J];中国医科大学学报;2014年06期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 李小平;郑磊贞;;胰腺癌干细胞信号通路研究进展[J];实用肿瘤杂志;2015年02期

2 吴共发;赵海燕;何楠;韩慧霞;;miR-200a在结直肠癌细胞系中的表达及其对高转移细胞系Lovo的影响[J];南方医科大学学报;2015年03期

3 谭国斌;邱明宁;陈合格;柳建军;;miR-200c与肿瘤进展关系的研究进展[J];中国肿瘤生物治疗杂志;2015年01期

4 韩敬明;白久旭;张晓玲;崔汉民;李旭;曹宁;;转化生长因子β调控miR-200b-200a-429启动子活性[J];第二军医大学学报;2014年06期

5 杨西胜;汪建林;李小磊;李海民;;β-catenin参与肿瘤干细胞形成和增殖转移的研究进展[J];现代肿瘤医学;2014年04期

6 朱名毅;姚金光;刘津;;miR-200c在肿瘤发生发展中的研究进展[J];右江民族医学院学报;2014年01期

7 胡优;何宋兵;朱新国;;MicroRNA与Wnt/β-catenin通路在大肠癌发生发展中的研究进展[J];医学研究生学报;2014年02期

8 王小军;周良芬;张华;;miR-200c在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义[J];中国现代医生;2013年28期

9 蔡晓波;李庆;郭俊明;徐进;季林丹;;MicroRNA与食管癌的研究进展[J];中国细胞生物学学报;2013年09期

10 鲍欣;杨艳明;刘念;尹光浩;孟凡旭;程颖;刘林林;;miR-21在结肠癌与癌旁组织中的表达及其临床意义[J];吉林大学学报(医学版);2013年02期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 陈清华;韩云蕾;马尧;燕永亮;平淑珍;陆伟;;生物固氮基因簇结构与进化研究进展[J];中国农业科技导报;2013年04期

2 江舸,李伟,金由辛,王德宝;水稻snoRNA47基因簇的初步鉴定[J];生物化学与生物物理学报;2002年05期

3 沈德新;核糖体核糖核酸基因簇在细菌系统分类中的研究进展[J];医学综述;2004年02期

4 张群;罗艳;张士璀;;MiR-183基因簇对动物感觉器官功能和发育及肿瘤发生的调控[J];中国生物化学与分子生物学报;2012年07期

5 张雁峰;张锐;宿兵;;MicroRNA基因簇的多样性与进化[J];中国科学(C辑:生命科学);2009年01期

6 闫晓红;王志鹏;王宁;;鸡mir-17-92基因簇的结构、功能及其调控[J];动物学研究;2012年05期

7 李小慧;王凯;吴建盛;汤丽华;;miR-430基因簇的生物信息学分析[J];南京邮电大学学报(自然科学版);2014年02期

8 胡志浩，陶美凤，鲍锴，周秀芬，周启，，邓子新;一个巨大的抗真菌抗生素基因簇及其与植物生物技术的潜在关系[J];高技术通讯;1996年06期

9 李华;王利娟;何t

本文编号：556218