基因芯片在筛查儿童过敏性紫癜差异基因中的研究
本文关键词:基因芯片在筛查儿童过敏性紫癜差异基因中的研究
【摘要】:目的应用基因表达谱芯片技术筛选过敏性紫癜患儿疾病发生及肾损伤相关基因,以期从分子水平探讨儿童过敏性紫癜发生发展及肾损伤发生机制。方法选取2010年1月至2010年12月在江西省儿童医院住院的无血缘关系的中国汉族过敏性紫癜患儿6例,根据有无肾脏损害分为单纯过敏性紫癜组3例(HSP组)和紫癜性肾炎组3例(HSPN组),另外选取同期在本院门诊体检且与HSP组和HSPN组性别、年龄相匹配的无血缘关系的中国汉族健康儿童3例作为对照组,分别检测各组患儿外周血基因表达谱情况,用相关生物信息学分析方法对不同实验组间基因表达谱进行差异分析。结果⑴单纯过敏性紫癜组与对照组间共有1064条差异表达基因,其中上调基因661条,下调基因403条,2倍以上差异基因225条,3倍以上6条;⑵紫癜性肾炎组与对照组间共有1326条差异表达基因,其中上调基因397条,下调基因929条,其中2倍以上差异基因619条,3倍以上103条;3、紫癜性肾炎组与单纯过敏性紫癜组间共有830条差异表达基因,其中上调基因445条,下调基因385条,2倍以上差异基因283条,3倍以上51条。4、2倍以上差异表达基因经GO分析,发现主要涉及炎症/免疫、细胞结构/功能、物质/能量代谢、信号转导/传递、转录/翻译等生物学过程。结论基因芯片能筛查出过敏性紫癜差异表达基因,为深入研究这些差异表达基因在过敏性紫癜中的作用提供了基础研究。
【作者单位】: 江西省儿童医院肾内科;
【关键词】: 基因芯片 过敏性紫癜 差异基因
【基金】:江西省卫生厅重大攻关计划(20084008)
【分类号】:R725.5
【正文快照】: 过敏性紫癜(Henoch Schonlein purpura,HSP)是一种儿童期常见的小血管炎,其发病机制目前尚不明确,研究显示某些基因可能参与了HSP的发病过程,如IL-18[1]、MMPs[2,3]、MEFV[4,5]等,但这些研究主要集中在某一单个基因在HSP发生、发展中的作用。而基因芯片能大规模平行检测不同样
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