基因重组型番鸭细小病毒FJM3的全基因组特征
本文关键词:基因重组型番鸭细小病毒FJM3的全基因组特征
【摘要】:从1例未免疫雏番鸭细小病毒活疫苗与鹅细小病毒活疫苗的临床病死雏番鸭脏器中成功分离到1株番鸭细小病毒(FJM3株)。为明确其基因组特征,运用PCR方法,扩增出番鸭细小病毒FJM3株全基因组。结果表明,FJM3株基因组全长为5017nt,其基因组结构和经典番鸭细小病毒参考毒株一致。序列比对结果表明,FJM3株全基因组序列与GenBank中登录的经典MDPV参考株(FM株)核苷酸序列同源性为94.0%,与番鸭源GPV参考株(Y株)核苷酸序列同源性为85.6%。全基因组遗传进化分析表明,FJM3株处于MDPV遗传进化分支;VP1基因遗传分析表明,FJM3株处于经典MDPV遗传进化分支;VP3遗传进化表明,FJM3株处于GPV遗传进化分支。对FJM3株和参考株(FM株、Y株和SYG61v)进行遗传重组分析表明,该毒株于存在2处MDPV与GPV的基因重组现象。
【作者单位】: 福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;
【关键词】: 番鸭细小病毒 基因组 重组 序列分析
【基金】:现代农业产业体系建设专项基金资助项目(CARS-43) 公益行业农业科研专项基金资助项目(201003012) 福建省农业科学院“青年科技英才百人计划”项目(YC2015-12) 福建省自然科学基金资助项目(2015J01114) 新世纪“百千万人才工程”国家级人选科研补助基金资助项目(NCNCMTPC-2009)
【分类号】:S852.65
【正文快照】: *Corresponding author,E-mail:huangyu_815@163.com番鸭感染细小病毒病最早由本研究室林世棠等[1]于国内外首次报道。主要临床特征为张口呼吸、腹泻、胰腺出血或见有白色坏死点、十二指肠黏膜出血,主要侵害3周龄内的雏番鸭[2-6]。随后,番鸭细小病毒病在我国台湾地区、法国、
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,本文编号:631486
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