灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克

发布时间：2017-08-06 21:15

  本文关键词：灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析

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【摘要】：目的基于前期对灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides转录组测序结果,从灰毡毛忍冬RNA中克隆灰毡毛忍冬MADS-box基因家族蕾期延长相关基因AGL15,并对其进行生物信息学及表达分析。方法对灰毡毛忍冬总RNA进行反转录酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)和c DNA末端快速扩增反应(rapid amplification of c DNA ends,RACE),获得完整的开放阅读框(ORF)。运用生物信息学的方法对该序列进行同源性分析和相似性比较,预测编码蛋白,并对其进行各种理化性质分析。运用半定量PCR测得该基因在灰毡毛忍冬不同部位的表达情况。结果获得AGL15基因,ORF长795 bp,编码264个氨基酸,与葡萄Vitis vinifera中MADS-box基因家族AGL15基因相似性最高,且包含MADS和K-box的保守序列。AGL15蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中,在灰毡毛忍冬各部位均有表达。结论首次从灰毡毛忍冬中克隆得到可能控制蕾期延长的基因,分析了其在灰毡毛忍冬不同部位表达差异性,为灰毡毛忍冬蕾期延长研究提供参考。
【作者单位】： 湖南中医药大学第一附属医院;湖南中医药大学;湖南省农业科学院;
【关键词】： 灰毡毛忍冬 蕾期延长 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81203007) 湖南省自然科学基金资助(13JJ9010) 湖南省教育厅科技创新平台(14K071) 湖南省研究生科研创新项目(CX2014B368) 湖南省“中药学”重点学科建设项目资助(湘教通[2011]76号:zy201403,zy201505)
【分类号】：S567.19
【正文快照】： 灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides Hand.-Mazz.为忍冬科植物。干燥花蕾或带初开的花为中药[1],具有清热解毒,凉散风热的功效,临床上广泛用于治疗痈肿疔疮、喉痹、丹毒、热毒血痢、风热感冒、温热发病等症,也可作为提取绿原酸或挥发油的原料,长期以来如何解决灰毡毛忍冬蕾期短

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本文编号：631470